Высокопроизводительные вычисления на кластерах. Беликов Д.А - 9 стр.

UptoLike

ВУЗ: 

ТГУ | Томск

Составители: 

Рубрика: 

9
Пиковая производительность кластера СКИФ Cyberia
12 Тфлопс, реальная на тесте Linpack – 9,013 Тфлопс. В 2007 г. по
своим показателям этот суперкомпьютер занимал 105-е место в спи-
ске TOP-500 (29-я редакция) и 1-е место в списке TOP-50 (5-я и 6-я
редакции). На кластере СКИФ Cyberia установлено следующее
программное обеспечение:
операционная система Linux SUSE Enterprise Server 10.0;
операционная система Microsoft Windows Compute Cluster
Server 2003;
поддержка стандартов параллельного программирования
MPI и OpenMP;
средства разработки приложений – высокопроизводительные
оптимизирующие компиляторы с языков С/С++/Fortran (In-
tel 9.1, PGI 7.0);
средства параллельной отладки и трассировки приложений
(Intel Vtune, TotalView 8.3);
системы управления заданиями и мониторинга для супер-
компьютера (Ganglia);
специализированное программное обеспечение – пакеты для
научных и инженерных расчетов Fluent и ANSYS, модели-
рующие системы для исследований погоды и климата MM5 и
WRF, системы для решения задач охраны окружающей сре-
ды CAMx и CMAQ; программа для докинга низкомолеку-
лярных лигандов в белковые рецепторы AUTODOCK и ком-
плекс программ для визуализации и анализа молекулярной
структуры MGLTools, квантовохимический комплекс
GAMESS;
библиотеки для проведения параллельных вычислений
PETSc, FFTW, MKL, SPRNG.
Прежде чем приступить к написанию параллельной программы
для исследовательских целей, необходимо выяснить следующие
вопросы:
1) Будет ли созданная параллельная программа работать быст-
рее, чем ее последовательные варианты?
2) Соизмерим ли полученный выигрыш во времени, который
дает параллельная программа, с затратами на программирование?
Частичные ответы на эти вопросы могут быть получены на осно-
ве закона Амдаля. Он устанавливает связь между ускорением
p
S

Страницы