Современная систематика прокариот. Грабович М.Ю - 4 стр.

                                         4
рассматриваются      в    качестве    трех самостоятельных       линий    развития.
Сравнительный анализ белковых последовательностей доменов Eucarya, Archaea и
Bacteria показал более высокую филогенетическую близость доменов Eucarya и Archaea
нежели Archaea и Bacteria. Строение генетического аппарата Archaea сближает их с
эукариотами, с другой стороны, они имеют типичные признаки прокариот. Таким
образом, Archaea и Bacteria – прокариоты, домен Eucarya – эукариоты.
       Согласно традиционной системе классификации домены подразделяются на типы
(филумы), классы, отделы (порядок), семейства.
       В данном пособии будут изложены основы современной систематики прокариот.
                             Общая характеристика прокариот
       Прокариоты – это мельчайшие организмы, обладающие клеточным строением; их
размеры составляют 0,2-10 мкм. Плазматическая мембрана образует ламинарные,
тубулярные, везикулярные впячивания внутрь клетки, на которых обычно протекают
процессы дыхания и фотосинтеза. Цитоплазма неподвижна, микротрубочки
отсутствуют. Рибосомы 70 S типа располагаются в цитоплазме (у одного рода Архей
более высокая константа седиментации). Экзоцитоз, эндоцитоз и псеудоподиальное
движение не обнаружены.
       Основной чертой молекулярной организации прокариот является отсутствие в их
клетках ядра, отделенного ядерной мембраной от цитоплазмы. В отличие от эукариот,
геном прокариот построен очень компактно. Количество некодирующих
последовательностей нуклеотидов минимально, интроны редки. У прокариот для
кодирования белков часто используются две или все три рамки считывания одной и той
же последовательности нуклеотидов гена, что повышает кодирующий потенциал их
генома без увеличения его размера. Многие механизмы регуляции экспрессии генов,
использующиеся у эукариот, никогда не встречаются у прокариот. Простота строения
генома объясняется их упрощенным жизненным циклом, на протяжении которого
клетки не претерпевают сложных дифференцировок, связанных с переключением
экспрессии одних групп генов на другие.
       Прокариоты встречаются в самых разнообразных местах: в атмосфере, в океанах,
реках и особенно много их в почве.
                        Характеристика доменов Archaea и Bacteria
В домене Archaea выделяют два филума:
1. Crenarchaeota – включает 1 класс Thermoprotei.
2. Euryarchaeota – включает 7 классов Methanobacteria, Metanococci, Halobacteria,
   Thermoplasmata, Thermococci, Archaeoglobi, Methanopyri.
       Среди архей выделяют следующие физиологические группы:
       - метаногенные Archaea;
       - сульфатредуцирующие Archaea;
       - экстремально галофильные Archaea;
       - экстремально термофильные So метаболизирующие Archaea;
       - Archaea, лишенные клеточной стенки.
В последнее время выделяют еще два филума в пределах домена Архей, это
Korarchaeota и Nanarcheota. Однако для первой группы соответствующие ей
организмы не выделены и не культивируются, а вторая группа была предложена в 2003
году и включает анаэробные термофильные кокки, размер генома которых не более 490