Составители:
Рубрика:
29
Ïðàêòè÷åñêàÿ ðàáîòà ñ ìîäåëüþ
Ïîÿñíåíèÿ ê îêíó ââîäà ïàðàìåòðîâ ìîäåëè
Which output plot would you like? – Êàêîé ãðàôèê âû õîòèòå óâèäåòü?
Âûáåðèòå îäíó èç ÷åòûðåõ äèàãðàìì (ñì. íèæå).
Please enter following values – Ââåäèòå çíà÷åíèÿ ñëåäóþùèõ ïàðàìåòðîâ:
PAB, PAb, PaB, Pab – ïåðâîíà÷àëüíûå ÷àñòîòû ãàìåò ÷åòûðåõ òèïîâ.
Ìîãóò ïðèíèìàòü ëþáûå çíà÷åíèÿ îò 0 äî 1, îäíàêî â ñóììå îíè
äîëæíû îáÿçàòåëüíî ñîñòàâëÿòü 1. Åñëè âû íå âûïîëíèòå ýòî óñëî-
âèå, ïðîãðàììà ñàìîñòîÿòåëüíî ââåäåò íåîáõîäèìûå êîððåêòèâû.
R – ÷àñòîòà ðåêîìáèíàöèè ìåæäó ëîêóñàìè (çíà÷åíèÿ ìåæäó 0 è 0.5). R =
0 îçíà÷àåò ïîëíîå ñöåïëåíèå, R = 0.5 – îòñóòñòâèå ñöåïëåíèÿ.
wAABB, wAaBB, waaBB è ò.ä. – çíà÷åíèÿ ïðèñïîñîáëåííîñòåé îñîáåé
äåâÿòè âîçìîæíûõ ãåíîòèïîâ. Çäåñü ìîæíî èñïîëüçîâàòü êàê îòíî-
ñèòåëüíóþ (ò.å. çíà÷åíèÿ â èíòåðâàëå îò 0 äî 1), òàê è àáñîëþòíóþ
(ëþáûå ïîëîæèòåëüíûå ÷èñëà) ïðèñïîñîáëåííîñòü.
How many generations do you want to run? – Ñêîëüêî ïîêîëåíèé âû
õîòèòå ïðîìîäåëèðîâàòü? Ïî óìîë÷àíèþ – 30. ×èñëî ïîêîëåíèé,
íåîáõîäèìîå äëÿ äîñòèæåíèÿ ðàâíîâåñíîãî ñîñòîÿíèÿ, çàâèñèò â
îñíîâíîì îò ñèëû îòáîðà. Êàê ïðàâèëî, áûâàåò äîñòàòî÷íî ìåíåå
100 ïîêîëåíèé (ìàêñèìàëüíîå çíà÷åíèå – 2000).
Ïîÿñíåíèÿ ê îêíó âûâîäà ðåçóëüòàòîâ ìîäåëèðîâàíèÿ
Ïðîãðàììà ïðåäñòàâëÿåò ðåçóëüòàòû ñâîåé ðàáîòû â âèäå ÷åòûðåõ
äèàãðàìì, êîòîðûå ìîæíî âûçûâàòü ïîî÷åðåäíî, íàæèìàÿ <Space Bar>:
P vs t – èçìåíåíèÿ ÷àñòîò ãàìåò âñåõ ÷åòûðåõ òèïîâ (P
AB
, P
Ab
, P
aB
è
P
ab
) îò ïîêîëåíèÿ ê ïîêîëåíèþ.
p vs t – èçìåíåíèÿ ÷àñòîò âñåõ ÷åòûðåõ àëëåëåé (p
A
, p
a
, p
B
è p
b
) îò
ïîêîëåíèÿ ê ïîêîëåíèþ.
D vs t – ãðàôèê äèíàìèêè êîýôôèöèåíòà íåðàâíîâåñíîñòè ïî
ñöåïëåíèþ D âî âðåìåíè.
wbar vs t – ãðàôèê èçìåíåíèÿ ñðåäíåé ïðèñïîñîáëåííîñòè ïîïóëÿöèè
îò ïîêîëåíèÿ ê ïîêîëåíèþ.
 âåðõíåé ÷àñòè ýêðàíà ïðîãðàììà âûâîäèò èñõîäíûå çíà÷åíèÿ ïðèñ-
ïîñîáëåííîñòåé ãåíîòèïîâ è êîýôôèöèåíòîâ R è D.
Èññëåäîâàíèå ìîäåëè
Ðåêîìåíäóåì íà÷àòü ðàáîòó ñ ìîäåëüþ ñ ïàðàìåòðàìè, óñòàíîâëåííû-
ìè ïî óìîë÷àíèþ. Îíè ìîäåëèðóþò ñèòóàöèþ îòñóòñòâèÿ îòáîðà (ïðèñïî-
ñîáëåííîñòè âñåõ ãåíîòèïîâ îäèíàêîâû) ïðè èçíà÷àëüíî íåáîëüøîé âåëè-
÷èíå êîýôôèöèåíòà D = 0.05 è ïîçâîëÿþò óâèäåòü ïðîöåññ äîñòèæåíèÿ
ñîñòîÿíèÿ ðàâíîâåñíîñòè ïî ñöåïëåíèþ: D ïîñòåïåííî ïðèáëèæàåòñÿ ê
íóëþ, à ÷àñòîòû ãàìåò ñòàáèëèçèðóþòñÿ è äàëåå íå ìåíÿþòñÿ. ×àñòîòû
Страницы
- « первая
- ‹ предыдущая
- …
- 28
- 29
- 30
- 31
- 32
- …
- следующая ›
- последняя »
