Практикум по математическому моделированию в теории эволюции. Часть 1. Факторы микроэволюции. Кипятков В.Е. - 35 стр.

UptoLike

Составители: 

Рубрика: 

34
s – êîýôôèöèåíò îòáîðà ïðîòèâ ãåíîòèïà aa (çíà÷åíèÿ îò 0 äî 1).
h – ïîêàçàòåëü ñòåïåíè äîìèíèðîâàíèÿ.
:÷àñòîòà ìóòèðîâàíèÿ àëëåëè A â a çà îäíî ïîêîëåíèå (çíà÷åíèÿ îò
0.0001 äî 1).
How many generations do you want to simulate?Ñêîëüêî ïîêîëåíèé âû
õîòèòå ïðîìîäåëèðîâàòü? Ïî óìîë÷àíèþ ñîñòàâëÿåò 200. Â
çàâèñèìîñòè îò ñèëû îòáîðà âàì ìîæåò ïîòðåáîâàòüñÿ îò 10 äî
1000 ïîêîëåíèé (ìàêñèìàëüíîå çíà÷åíèå – 2000).
Do you want to begin with a single frequency or a six-frequency stability
analysis? Õîòèòå ëè âû íà÷àòü àíàëèç ñòàáèëüíîñòè ñ îäíîé
÷àñòîòû èëè ñ øåñòè ÷àñòîò? Ïî óìîë÷àíèþ ïðîãðàììà
ìîäåëèðóåò ïðîöåññ îòáîðà îäíîâðåìåííî â øåñòè ïîïóëÿöèÿõ,
îòëè÷àþùèõñÿ íà÷àëüíîé ÷àñòîòîé p, ÷òî î÷åíü óäîáíî äëÿ
àíàëèçà. Íî ïðè æåëàíèè âû ìîæåòå âûáðàòü ðåæèì ìîäåëèðîâà-
íèÿ îò îäíîé íà÷àëüíîé ÷àñòîòû, è â ýòîì ñëó÷àå âàì íåîáõîäèìî
åå ââåñòè:
Single starting frequencyÎäíà íà÷àëüíàÿ ÷àñòîòàËþáàÿ âåëè÷èíà
ìåæäó 0 è 1; ïî óìîë÷àíèþ – 0.1. Òîëüêî â ýòîì ðåæèìå ìîäåëèðî-
âàíèÿ îêàçûâàåòñÿ äîñòóïíûì ãðàôèê èçìåíåíèé ÷àñòîò ãåíîòèïîâ
âî âðåìåíè.
Ïîÿñíåíèÿ ê îêíó âûâîäà ðåçóëüòàòîâ ìîäåëèðîâàíèÿ
Ïðîãðàììà ïðåäñòàâëÿåò ðåçóëüòàòû ñâîåé ðàáîòû â âèäå òðåõ (èëè
÷åòûðåõ, åñëè âûáðàíà îäíà èñõîäíàÿ ÷àñòîòàñì. âûøå) äèàãðàìì,
êîòîðûå ìîæíî âûçûâàòü ïîî÷åðåäíî, íàæèìàÿ <Space Bar>:
p vs t èçìåíåíèå îæèäàåìîé ÷àñòîòû àëëåëè A îò ïîêîëåíèÿ ê ïîêîëå-
íèþ.
Genotypic Freq vs t – èçìåíåíèÿ îæèäàåìûõ ÷àñòîò òðåõ ãåíîòèïîâ îò
ïîêîëåíèÿ ê ïîêîëåíèþ (äîñòóïíà òîëüêî ïðè âûáîðå îäíîé èñõîä-
íîé ÷àñòîòû p).
)p vs p ãðàôèê çàâèñèìîñòè ïðèðàùåíèÿ ÷àñòîòû àëëåëè A çà îäíî
ïîêîëåíèå )p (ò.å. ñêîðîñòè îòáîðà) îò åå ÷àñòîòû p.
wbar vs p ãðàôèê çàâèñèìîñòè ñðåäíåé ïðèñïîñîáëåííîñòè ïîïóëÿ-
öèè îò ÷àñòîòû àëëåëè (àäàïòèâíûé ëàíäøàôò).
 âåðõíåé ÷àñòè ýêðàíà ïðîãðàììà âûâîäèò çíà÷åíèÿ èñõîäíûõ
ïàðàìåòðîâ, à òàêæå âåëè÷èíó ðàâíîâåñíîé ÷àñòîòû q àëëåëè a.
Èññëåäîâàíèå ìîäåëè
Ïðè ëþáûõ çíà÷åíèÿõ ÷àñòîòû ìóòèðîâàíèÿ è êîýôôèöèåíòà îòáîðà
àëëåëüíûå ÷àñòîòû ðàíüøå èëè ïîçæå äîñòèãàþò ðàâíîâåñèÿ, ò.å. âðåä-
íàÿ ðåöåññèâíàÿ ìóòàöèÿ íå ìîæåò áûòü ïîëíîñòüþ óñòðàíåíà îòáîðîì
èç ïîïóëÿöèè. Èñïîëüçóÿ ðàçëè÷íûå çíà÷åíèÿ ïàðàìåòðîâ îïðåäåëèòå,