Математическое моделирование структуры соединений с помощью пакета программ Hyperchem 7.5. Резников А.А - 13 стр.

UptoLike

Рубрика: 

13
Для соединения двух атомов между собой наведите значок мыши на
атом и , не отпуская левой клавиши, проведите линию до другого атома. Таким
образом , все размещенные в пространстве атомы можно соединить в одну
молекулу посредством химических связей .
Существует другой способ построения молекулы . После того как Вы
разместили один атом в рабочей области, не отпуская левой кнопки мыши,
проведите от него линию до места, где должен находиться второй атом и ,
однократно щелкните . Это позиция второго атома такого же типа.
Рис.11. Связанные атомы молекулы воды .
При построении молекул необходимо учитывать , что не все из них
имеют плоскую структуру, поэтому для размещения отдельных атомов в
пространстве под определенным углом относительно друг друга молекулу
можно разворачивать , выбрав кнопку Rotate-out-of-plane (Вращать ) на
панели инструментов .
Чтобы химическую связь сделать кратной , значок мыши необходимо
разместить рядом с линией , изображающей одинарную связь, и однократно
(двукратно) нажать на левую клавишу мыши.
Для удаления связей или атомов пользуются правой клавишей мыши.
2.2. Выделение атомов и групп атомов
Удалить или копировать атом , несколько атомов или всю молекулу
можно после их выделения . Для этой цели служит кнопка Select,
размещенная на панели инструментов .
Вначале необходимо выбрать параметры выделения в меню Select.
Можно выделять как отдельные атомы (Atoms), остатки (Residues), так и
целые молекулы (Molecules), по отдельности или вместе .
                                          13
      Д л я соединения двух атомов меж ду собой наведите значок мы ш и ⊕ на
атом и, не отпуская л евой кл авиш и, проведите л инию додругогоатома. Т аким
образом, все размещ енны е в пространстве атомы мож но соединить в одну
мол екул упосредством химических свя зей.
      С ущ ествует другой способ построения мол екул ы . П осл е того как В ы
разместил и один атом в рабочей обл асти, не отпуская л евой кнопки мы ш и,
проведите от него л инию до места, где дол ж ен находиться второй атом и,
однократнощ ел кните. Э топозиция второгоатоматакогож е типа.




                      Рис.11. С вя занны е атомы мол екул ы воды .
      П ри построении мол екул необходимо учиты вать, что не все из них
имею т пл оскую структуру, поэтому дл я размещ ения отдел ьны х атомов в
пространстве под определ енны м угл ом относител ьно друг друга мол екул у
мож но разворачивать, вы брав кнопку            Rotate-out-of-plane (В ращ ать) на
панел и инструментов.
      Чтобы химическую свя зь сдел ать кратной, значок мы ш и ⊕ необходимо
разместить ря дом с л инией, изображ аю щ ей одинарную свя зь, и однократно
(двукратно) наж ать нал евую кл авиш умы ш и.
      Д л я удал ения свя зей ил и атомов пол ьзую тся правой кл авиш ей мы ш и.

                   2.2. В ыделени е атомов и групп атомов
       У дал ить ил и копировать атом, нескол ько атомов ил и всю мол екул у
мож но посл е их вы дел ения . Д л я этой цел и сл уж ит кнопка      Select,
размещ енная напанел и инструментов.
       В начал е необходимо вы брать параметры вы дел ения в меню Select.
Мож но вы дел я ть как отдел ьны е атомы (Atoms), остатки (Residues), так и
цел ы е мол екул ы (Molecules), поотдел ьности ил и вместе.