Математическое моделирование структуры соединений с помощью пакета программ Hyperchem 7.5. Резников А.А - 38 стр.

UptoLike

Рубрика: 

38
осуществление SCF-итераций , точность волновых функций и энергии, т.к.
уменьшается число рассчитываемых двухэлектронных интегралов .
Buffer size (Размер буфера) определяет размер операционной памяти
( задается в количестве фрагментов по 8 байт), который требуется для хранения
двухэлектронных интегралов до того, как записать их во временный файл на
жестком диске (выбор места размещения этого файла может быть сделан в
меню File/Preferences/Path). В случае сбоя временные файлы необходимо
удалять , применяя команды операционной системы .
В блоке Integral Format задается формат хранения интегралов
Regular (Обычный) определяет использование обычного формата для
записи двухэлектронных интегралов . HyperChem использует 16 байт
для записи каждого из интегралов . Первые 8 байт хранят 4 индекса
интеграла, а последние 4 его значение .
Raffenetti определяет использование формата Раффенетти, который
позволяет более просто формировать матрицу Фока в ходе SCF-
расчета. Этот формат, как правило, требует больше памяти и больше
дискового пространства, однако позволяет повышать скорость расчета.
Его нельзя использовать при проведении MP2-расчетов и CI.
При выборе пункта Direct SCF calculation (Прямое SCF вычисление)
двухэлектронные интегралы рассчитываются на каждой итерации, а не один
раз перед SCF-шагом . Такой расчет гораздо медленнее, но он позволяет не
использовать дисковое пространство и операционную память под большое
количество интегралов . Включение этой опции требуется при расчетах
больших систем на компьютерах с маленьким диском и памятью .
В блоке Ghost-atoms Control (Использование атомов - призраков ) можно
задать использование выделенных атомов - призраков (Use ghost-atoms
selection). Эта опция позволяет вводить центры , которым приписываются
базисные функции тех или иных атомов , при этом в систему не вводятся ни
дополнительные ядра, ни дополнительные электроны . Использование таких
виртуальных” атомов может приводить к артефактам .
Для использования атомов - призраков необходимо в меню Select,
предварительно сделав соответствующее выделение , выбрать пункт Name
Selection (Дать название выделенному), отметить Other (Другое ) и приписать
ему имя ghost-atoms. Опция активна только для одноточечных расчетов .
Блок MO initial guess (стартовое значение МО ) определяет начальное
заполнение коэффициентов молекулярных орбиталей , которое требуется для
проведения SCF-расчетов . Обычно эти значения получаются из решений
уравнения Хартри- Фока- Рутаана с заменой матрицы Фока ядром
гамильтониана (режим Core Hamiltonian).
Т .к. в редких случаях вышеописанный метод дает некорректные
результаты , то HyperChem предоставляет и другие методы (которые имеют
свои собственные ограничения ):
Projected Huckel - строятся по методу Хюккеля;
Projected CNDO - строятся методом CNDO;
                                           38
осущ ествл ение SCF-итераций, точность вол новы х ф ункций и энергии, т.к.
уменьш ается числ орассчиты ваемы х двухэл ектронны хинтеграл ов.
       Buffer size (Размер буф ера) определ я ет размер операционной памя ти
(задается в кол ичестве ф рагментов по8 байт), которы й требуется дл я хранения
двухэл ектронны х интеграл ов дотого, как записать их вовременны й ф айл на
ж естком диске (вы бор места размещ ения этого ф айл а мож ет бы ть сдел ан в
меню File/Preferences/Path). В сл учае сбоя временны е ф айл ы необходимо
удал я ть, применя я команды операционной системы .
       В бл оке Integral Format задается ф орматхранения интеграл ов
     • Regular (О бы чны й) определ я ет испол ьзование обы чногоф ормата дл я
         записи двухэл ектронны х интеграл ов. HyperChem испол ьзует 16 байт
         дл я записи каж дого из интеграл ов. П ервы е 8 байт храня т 4 индекса
         интеграл а, апосл едние 4 – егозначение.
     • Raffenetti определ я ет испол ьзование ф ормата Раф ф енетти, которы й
         позвол я ет бол ее просто ф ормировать матрицу Ф ока в ходе SCF-
         расчета. Э тот ф ормат, как правил о, требует бол ьш е памя ти и бол ьш е
         дисковогопространства, однакопозвол я ет повы ш ать скорость расчета.
         Е гонел ьзя испол ьзовать при проведении MP2-расчетов и CI.
        П ри вы боре пункта Direct SCF calculation (П ря мое SCF вы числ ение)
двухэл ектронны е интеграл ы рассчиты ваю тся на каж дой итерации, а не один
раз перед SCF-ш агом. Т акой расчет гораздо медл еннее, но он позвол я ет не
испол ьзовать дисковое пространство и операционную памя ть под бол ьш ое
кол ичество интеграл ов. В кл ю чение этой опции требуется при расчетах
бол ьш ихсистем накомпью терах смал еньким диском и памя тью .
       В бл оке Ghost-atoms Control (И спол ьзование атомов-призраков) мож но
задать испол ьзование вы дел енны х атомов-призраков (Use ‘ghost-atoms’
selection). Э та опция позвол я ет вводить центры , которы м приписы ваю тся
базисны е ф ункции тех ил и ины х атомов, при этом в систему не вводя тся ни
допол нител ьны е я дра, ни допол нител ьны е эл ектроны . И спол ьзование таких
“виртуал ьны х” атомов мож етприводить картеф актам.
       Д л я испол ьзования атомов-призраков необходимо в меню Select,
предварител ьно сдел ав соответствую щ ее вы дел ение, вы брать пункт Name
Selection (Д ать название вы дел енному), отметить Other (Д ругое) и приписать
емуимя ghost-atoms. О пция активнатол ькодл я одноточечны х расчетов.
       Бл ок MO initial guess (стартовое значение МО ) определ я ет начал ьное
запол нение коэф ф ициентов мол екул я рны х орбитал ей, которое требуется дл я
проведения SCF-расчетов. О бы чно эти значения пол учаю тся из реш ений
уравнения Хартри-Ф ока-Рутаана с заменой матрицы                   Ф ока я дром
гамил ьтониана(реж им Core Hamiltonian).
       Т .к. в редких сл учая х вы ш еописанны й метод дает некорректны е
резул ьтаты , то HyperChem предоставл я ет и другие методы (которы е имею т
свои собственны е ограничения ):
     • Projected Huckel - строя тся пометодуХю ккел я ;
     • Projected CNDO - строя тся методом CNDO;