Математическое моделирование структуры соединений с помощью пакета программ Hyperchem 7.5. Резников А.А - 8 стр.

UptoLike

Рубрика: 

8
1.4. Открытие файла и установки отображения структур
В программе HyperChem создать структуру в рабочей области можно
тремя различными способами:
Инструментальные средства дают возможность создать двухмерную
( 2D) структуру и преобразовать ее с помощью построителя моделей
HyperChem (пункт Add H & Model Build меню Build) в трехмерный
(3D) вид.
Выбор остатков позволяет создать белки и нуклеиновые кислоты ,
последовательно выбрав из базы данных HyperChem уже готовые
остатки аминокислот и нуклеотидов .
Чтение данных (т.е. типы атомов , координаты ), которые были
сохранены в формате файла HyperChem (файл с расширением HIN)
или формате Белкового банка данных Brookhaven Protein Data Bank
(файл с расширением ENT), а также в ряде других форматов .
Для открытия HIN-файла требуется :
1. Переместить указатель мыши в левую верхнюю часть окна на меню
File.
2. Нажатием левой кнопки мыши открыть файловое меню .
3. В диалоговом окне выбрать Open (Открыть ).
4. Появится список файлов (Рис.3.), среди которых необходимо L-
нажатием кнопки мыши выбрать нужный и открыть его, нажав на
кнопку Open. К открытию файла приводит и двойной щелчок мышью
по файлу.
Рис.3. Окно диалога открытия файла
В результате появится молекула, сохраненная в файле, например -
бензола:
                                        8
         1.4. О ткрыти е файла и установки отображени я структур
     В программе HyperChem создать структуру в рабочей обл асти мож но
тремя разл ичны ми способами:
    • И нструментал ьны е средства даю т возмож ность создать двухмерную
       (2D) структуру и преобразовать ее с помощ ью построител я модел ей
       HyperChem (пункт Add H & Model Build меню Build) в трехмерны й
       (3D) вид.
    • В ы бор остатков позвол я ет создать бел ки и нукл еиновы е кисл оты ,
       посл едовател ьно вы брав из базы данны х HyperChem уж е готовы е
       остатки аминокисл оти нукл еотидов.
    • Чтение данны х (т.е. типы атомов, координаты ), которы е бы л и
       сохранены в ф ормате ф айл а HyperChem (ф айл с расш ирением HIN)
       ил и ф ормате Бел ковогобанка данны х Brookhaven Protein Data Bank
       (ф айл срасш ирением ENT), атакж е в ря де других ф орматов.

     Д л я откры тия HIN-ф айл атребуется :
    1. П ереместить указател ь мы ш и в л евую верхню ю часть окна на меню
       File.
    2. Н аж атием л евой кнопки мы ш и откры ть ф айл овое меню .
    3. В диал оговом окне вы брать Open (О ткры ть).
    4. П оя вится список ф айл ов (Рис.3.), среди которы х необходимо L-
       наж атием кнопки мы ш и вы брать нуж ны й и откры ть его, наж ав на
       кнопку Open. К откры тию ф айл а приводит и двойной щ ел чок мы ш ью
       поф айл у.




                       Рис.3. О кнодиал огаоткры тия ф айл а


     В резул ьтате поя вится мол екул а, сохраненная в ф ай л е, например -
бензол а: