Квантово-химические расчеты в программе Gaussian. Серба П.В - 1 стр.

UptoLike

40
диапазоне
180ºθ << . Торсионные углы могут принимать любое
значение.
Как видно из рисунка, величина
r
находится из расстояния между
задаваемым атомом 4 и базисным атомом 1, валентный угол
θ
угол между
атомами 4, 1 и 2 с вершиной на базисном атоме 1, торсионный угол
ϕ
это
угол между плоскостями 4, 1, 2 и 1, 2, 3, т.е. угол между перпендикулярами к
базовой оси, опущенными из одной точки в обе плоскости. Формат каждой
строки, описывающей атом, имеет вид
ATOM [n] atom1 atom2 atom3 [format –code].
Здесь
n - дополнительный параметр, связанный с замораживающимися
( freezing) атомами во время оптимизации,
atom1 , atom2 , atom3 - метки для ранее указанных атомов, которые будут
использоваться, чтобы определить положение текущих атомов,
Положение данного
ATOM атома определяют, задавая длину связи
r
,
как расстояние от
ATOM к atom1 , валентный угол
θ
, есть угол
образованный линией соединяющей
ATOM
и
atom1
, и линией
соединяющей
atom1 и atom2 , торсионный угол
ϕ
- угол, образованный
линией соединяющей
atom2
и
atom3
с плоскостью, образованной
ATOM
(данным атомом),
atom1
и
atom2
.
Дополнительный параметр код формата
codeformat
определяет
формат входа Z-матрицы. Его использование необходимо только тогда, когда
рассчитывается молекулярная система, разделенная двумя или тремя слоями,
каждый из которых обрабатывается разными химическими моделями
(вычисления ONIOM).
Если используется символ элемента для обозначения
ATOM
, то он
может сопровождаться другими алфавитно-цифровыми характерами, чтобы
создать метку идентификации для атома. Обычно за названием элемента
следует целое число идентификации: C1, C2, C3, и т. д.
Рассмотрим спецификацию молекулы этана
62
HC
0 1
C 0.00 0.00 0.00
C 0.00 0.00 1.52
H 1.02 0.00 -0.39
H -0.51 -0.88 -0.39
H -0.51 0.88 -0.39
H -1.02 0.00 1.92
0,1
C1
C2,C1,1.5
H3,C1,1.1,C2,111.2
H4,C1,1.1,C2,111.2,H3,120.
H5,C1,1.1,C2,111.2,H3,-120.
H6,C2,1.1,C1,111.2,H3,180.
539.2(075)
4903
С-32
МИНИСТЕРСТВО ОБРАЗОВАНИЯ И НАУКИ
РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ
ГОСУДАРСТВЕННОЕ ОБРАЗОВАТЕЛЬНОЕ УЧРЕЖДЕНИЕ
ВЫСШЕГО ПРОФЕССИОНАЛЬНОГО ОБРАЗОВАНИЯ
ТЕХНОЛОГИЧЕСКИЙ ИНСТИТУТ ЮЖНОГО
ФЕДЕРАЛЬНОГО УНИВЕРСИТЕТА В Г.ТАГАНРОГЕ
Серба П.В.
Мирошниченко С.П.
Блинов Ю.Ф.
КВАНТОВО-ХИМИЧЕСКИЕ
РАСЧЕТЫ В ПРОГРАММЕ GAUSSIAN
УЧЕБНОЕ ПОСОБИЕ ПО КУРСУ
«ФИЗИКА НИЗКОРАЗМЕРНЫХ
СТРУКТУР»
Таганрог 2012
КАФЕДРА ТЕХНОЛОГИИ МИКРО- И НАНОЭЛЕКТОННОЙ
АППАРАТУРЫ