ВУЗ:
Составители:
2
УДК 539.2(075.8)
Составители: П.В.Серба, С.П. Мирошниченко, Ю.Ф. Блинов
Квантово-химические расчеты в программе GAUSSIAN
по курсу «Физика низкоразмерных структур». Таганрог: Изд-во
ТТИ ЮФУ, 2012, 100 с.
Табл.5. Ил.7. Библиогр.: 14 назв.
В учебном пособии рассматривается квантово-химический
программный пакет Gaussian, его структура и задачи,
решаемые этим пакетом. Пособие предназначено для изучения в
курсе «Физика низкоразмерных структур» студентами
специальностей 210100 и 210600, а также может быть
полезно магистрантам, аспирантам и научным сотрудникам
специализирующихся в области химии, физике и
материаловедения.
Рецензент Е. Т. Замков, кандидат технических наук, доцент
кафедры КЭС, ТТИ ЮФУ
39
Остальные строки в спецификации молекулы задают тип элемента и
положение ядер для каждого атома в молекуле. Наиболее общий формат для
строки:
Символ элемента [-Тип атома [-Заряд]] [(параметр=значение [, ...])]
Координаты атома
Каждая строка содержит символ элемента, и дополнительно могут
указываться молекулярно-механические параметры атома. Остальная часть
строки содержит информацию
о местоположении атома, как в Декартовых
координатах, так и с помощью Z-матрицы.
Декартовы координаты являются наиболее простым способом
определения строения молекулы, и состоит в указании декартовых координат
x ,
y
, и z для каждого атома молекулы. В этом случае формат каждой
строки, описывающей атом, имеет вид
A
TOM X Y
Z
здесь
ATOM - символьное обозначение данного атома или атомный номер,
X
,
Y
,
Z
- набор декартовых координат.
Z-матрица – это формализованный способ расстановки атомов,
образующих молекулу, в трехмерном пространстве. Кроме того, такое
представление называют также внутренними координатами (internal
coordinates). Это представление определяет каждый атом системы через
атомный номер, длину связи, валентный угол и двугранный (торсионный)
угол. Под связью подразумевается вектор, направленный от одного атома к
другому. Любые три атома, положение которых было определено ранее,
называют базисными или реперными, причем первый базисный атом
принимается за центр полярной системы координат, второй базисный атом
задает базовую ось, а третий базисный атом – базовую плоскость полярной
системы координат.
Для однозначного определения положения атома 4 в пространстве
необходимо определить совокупность трех координат:
длину связи
r
,
валентный угол
θ
и торсионного угла
ϕ
. Валентные углы должны быть в
