ВУЗ:
Составители:
58
Input orientation:
------------------------------------------------------
---------------
Center Atomic Atomic Coordinates
(Angstroms)
Number Number Type X Y
Z
------------------------------------------------------
---------------
1 8 0 0.001430
0.000000 0.001074
2 1 0 0.003298
0.000000 0.944118
3 1 0 0.907551
0.000000 -0.260234
------------------------------------------------------
---------------
Distance matrix (angstroms):
1 2 3
1 O 0.000000
2 H 0.943046 0.000000
3 H 0.943046 1.506034 0.000000
Stoichiometry H2O
Framework group C2V[C2(O),SGV(H2)]
Deg. of freedom 2
Full point group C2V
Largest Abelian subgroup C2V NOp 4
Largest concise Abelian subgroup C2 NOp 2
Standard orientation:
------------------------------------------------------
---------------
Center Atomic Atomic Coordinates
(Angstroms)
Number Number Type X Y
Z
------------------------------------------------------
---------------
1 8 0 0.000000
0.000000 0.113543
2 1 0 0.000000
0.753017 -0.454173
3 1 0 0.000000 -
0.753017 -0.454173
------------------------------------------------------
63
так:
Error termination request processed by link 9999.
Error termination via Lnk1e in /g03/l9999.exe at Thu
Jan 12 08:37:38
Job cpu time: 0 days 0 hours 12 minutes 10.2
seconds.
то есть, выдается сообщение об ошибке в линке 9999.
Основными причинами того, что задача не сошлась могут быть:
• Неудачно задана исходная геометрия и задача сваливается не в тот
минимум или вообще расходится;
• Минимум энергии очень пологий – задача сходится медленно;
• Задача зациклилась и скачет между несколькими эквивалентными
состояниями.
Для
устранения ошибки могут быть полезны следующие рекомендации:
• Исправить исходную геометрию;
• Продолжить оптимизацию с полученной геометрии и при этом
увеличить количество шагов оптимизации;
• Выбрать другой алгоритм поиска минимума энергии (Opt=EF), начав
расчет с положения с минимальной энергией.
При частичной оптимизации определяют координаты каких атомов
следует оптимизировать, а каких заморозить
. Используется опция
Opt=ReadFreeze. Список атомов указывают в отдельном разделе файл-
задания, помещенного после спецификации молекулы (обычно в декартовых
координатах), разделенного пустой строкой. Этот раздел имеет формат:
atoms=list [notatoms=list]
здесь list список номеров атомов, разделенных запятой или диапазон атомов
или тип атомов, например:
atoms=3-6,17 notatoms=5 Добавляются 3, 4, 6 и 17 в
список атомов.
atoms=3 C 18-30 notatoms=H
Добавляются все C и не H
из атомов 3, 18-30.
atoms=C N notatoms=5 Добавляются все C и N
атомы кроме 5 атома.
atoms=1-5 notatoms=H atoms=8-10 Добавляются все не H
атомы кроме 1-5,
и все атомы 8-10
независимо от типа.
Без ключевого слова atoms:
1,3,5 7 Добавляются атомы 1, 3, 5 и 7.
Следующее задание иллюстрирует частичную оптимизацию:
Страницы
- « первая
- ‹ предыдущая
- …
- 36
- 37
- 38
- 39
- 40
- …
- следующая ›
- последняя »