ВУЗ:
Составители:
Рубрика:
3
СОДЕРЖАНИЕ
ВВЕДЕНИЕ . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 4
1. КАРТИРОВАНИЕ ГЕНОМА . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 5
1.1. Цитологические карты хромосом . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 6
1.1.1. Гибридизация in situ: ISH - и FISH-гибридизация . . . . . . . . . .
8
1.1.2. Хромосомный пейнтинг . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 9
1.1.3. Гибридизация соматических клеток . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 11
1.2. Генетическое картирование . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
11
1.3. Молекулярные маркеры ДНК и их использование для
генетического картирования . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
14
1.3.1. ПДРФ -маркеры . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 15
1.3.2. Молекулярные маркеры , основанные на полимеразной
цепной реакции (ПЦР-маркеры ) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
16
1.3.3. Микросателлиты и минисателлиты как молекулярные
маркеры . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
25
1.4. Физическое картирование . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 27
1.4.1. Создание рестрикционных карт . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
28
1.4.2. Создание упорядоченных библиотек клонов. Карты контиг.
Процедура “Прогулка по хромосоме”. . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
30
1.4.3. Стратегии построения физической карты высокого
разрешения . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
30
1.5. Определение нуклеотидной последовательности генома
(секвенирование) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
34
1.6. Базы данных нуклеотидных последовательностей.
Компьютерная генетика (биоинформатика). Исследования in silico .
37
1.7. Кандидатное картирование . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 39
2. ГЕНОМИКА , ПРОТЕОМИКА И “ОБРАТНАЯ ГЕНЕТИКА”. . . . . . . 40
2.1. Геномика . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 40
2.2. Ортологичные и паралогичные гены . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 42
2.3. “Обратная генетика” . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 43
2.4. Протеом и протеомика . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 44
2.5. ДНК-микрочипы (ДНК-поля) и примеры их использования для
изучения геномов . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
45
2.6. Некоторые итоги сравнительного анализа геномов различных
организмов . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
48
3. ОБЛАСТИ ПРИМЕНЕНИЯ РЕЗУЛЬТАТОВ КАРТИРОВАНИЯ
ГЕНОМА . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
51
3.1. Геномная медицина. ДНК-диагностика. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 51
3.2. Обнаружение мутаций при наследственных заболеваниях
человека . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
55
3.3. Генетический паспорт и его значение . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
59
СЛОВАРЬ ТЕРМИНОВ . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
60
РЕКОМЕНДУЕМАЯ ЛИТЕРАТУРА . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
59
3 СОДЕРЖАНИЕ ВВЕДЕНИЕ . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 4 1. КАРТИРОВАНИЕ ГЕНОМА . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 5 1.1. Цитологические карты хромосом . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 6 1.1.1. Гибридизация in situ: ISH - и FISH-гибридизация . . . . . . . . . . 8 1.1.2. Хромосомный пейнтинг . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 9 1.1.3. Гибридизация соматических клеток . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 11 1.2. Генетическое картирование . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 11 1.3. Молекулярные маркеры ДНК и их использование для генетического картирования . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 14 1.3.1. ПДРФ-маркеры . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 15 1.3.2. Молекулярные маркеры, основанные на полимеразной цепной реакции (ПЦР-маркеры) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 16 1.3.3. Микросателлиты и минисателлиты как молекулярные маркеры . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 25 1.4. Физическое картирование . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 27 1.4.1. Создание рестрикционных карт . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 28 1.4.2. Создание упорядоченных библиотек клонов. Карты контиг. Процедура “Прогулка по хромосоме”. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 30 1.4.3. Стратегии построения физической карты высокого разрешения . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 30 1.5. Определение нуклеотидной последовательности генома (секвенирование) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 34 1.6. Базы данных нуклеотидных последовательностей. Компьютерная генетика (биоинформатика). Исследования in silico . 37 1.7. Кандидатное картирование . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 39 2. ГЕНОМИКА, ПРОТЕОМИКА И “ОБРАТНАЯ ГЕНЕТИКА”. . . . . . . 40 2.1. Геномика . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 40 2.2. Ортологичные и паралогичные гены . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 42 2.3. “Обратная генетика” . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 43 2.4. Протеом и протеомика . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 44 2.5. ДНК-микрочипы (ДНК-поля) и примеры их использования для изучения геномов . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 45 2.6. Некоторые итоги сравнительного анализа геномов различных организмов . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 48 3. ОБЛАСТИ ПРИМЕНЕНИЯ РЕЗУЛЬТАТОВ КАРТИРОВАНИЯ ГЕНОМА . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 51 3.1. Геномная медицина. ДНК-диагностика. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 51 3.2. Обнаружение мутаций при наследственных заболеваниях человека . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 55 3.3. Генетический паспорт и его значение . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 59 СЛОВАРЬ ТЕРМИНОВ . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 60 РЕКОМЕНДУЕМАЯ ЛИТЕРАТУРА . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 59