Картирование генома и обратная генетика. Буторина А.К - 3 стр.

UptoLike

Рубрика: 

3
СОДЕРЖАНИЕ
ВВЕДЕНИЕ . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 4
1. КАРТИРОВАНИЕ ГЕНОМА . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 5
1.1. Цитологические карты хромосом . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 6
1.1.1. Гибридизация in situ: ISH - и FISH-гибридизация . . . . . . . . . .
8
1.1.2. Хромосомный пейнтинг . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 9
1.1.3. Гибридизация соматических клеток . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 11
1.2. Генетическое картирование . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
11
1.3. Молекулярные маркеры ДНК и их использование для
генетического картирования . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
14
1.3.1. ПДРФ -маркеры . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 15
1.3.2. Молекулярные маркеры , основанные на полимеразной
цепной реакции (ПЦР-маркеры ) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
16
1.3.3. Микросателлиты и минисателлиты как молекулярные
маркеры . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
25
1.4. Физическое картирование . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 27
1.4.1. Создание рестрикционных карт . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
28
1.4.2. Создание упорядоченных библиотек клонов. Карты контиг.
Процедура Прогулка по хромосоме”. . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
30
1.4.3. Стратегии построения физической карты высокого
разрешения . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
30
1.5. Определение нуклеотидной последовательности генома
(секвенирование) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
34
1.6. Базы данных нуклеотидных последовательностей.
Компьютерная генетика (биоинформатика). Исследования in silico .
37
1.7. Кандидатное картирование . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 39
2. ГЕНОМИКА , ПРОТЕОМИКА И ОБРАТНАЯ ГЕНЕТИКА”. . . . . . . 40
2.1. Геномика . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 40
2.2. Ортологичные и паралогичные гены . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 42
2.3. Обратная генетика” . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 43
2.4. Протеом и протеомика . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 44
2.5. ДНК-микрочипы (ДНК-поля) и примеры их использования для
изучения геномов . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
45
2.6. Некоторые итоги сравнительного анализа геномов различных
организмов . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
48
3. ОБЛАСТИ ПРИМЕНЕНИЯ РЕЗУЛЬТАТОВ КАРТИРОВАНИЯ
ГЕНОМА . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
51
3.1. Геномная медицина. ДНК-диагностика. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 51
3.2. Обнаружение мутаций при наследственных заболеваниях
человека . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
55
3.3. Генетический паспорт и его значение . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
59
СЛОВАРЬ ТЕРМИНОВ . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
60
РЕКОМЕНДУЕМАЯ ЛИТЕРАТУРА . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
59
                                                         3
                                              СОДЕРЖАНИЕ

ВВЕДЕНИЕ . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .         4
1. КАРТИРОВАНИЕ ГЕНОМА . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .                             5
  1.1. Цитологические карты хромосом . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .                           6
    1.1.1. Гибридизация in situ: ISH - и FISH-гибридизация . . . . . . . . . .                                     8
    1.1.2. Хромосомный пейнтинг . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .                      9
    1.1.3. Гибридизация соматических клеток . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .                             11
  1.2. Генетическое картирование . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .                  11
  1.3. Молекулярные маркеры ДНК и их использование для
    генетического картирования . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .                    14
    1.3.1. ПДРФ-маркеры . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .             15
    1.3.2. Молекулярные маркеры, основанные на полимеразной
           цепной реакции (ПЦР-маркеры) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .                         16
    1.3.3. Микросателлиты и минисателлиты как молекулярные
           маркеры . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .      25
  1.4. Физическое картирование . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .                  27
    1.4.1. Создание рестрикционных карт . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .                       28
    1.4.2. Создание упорядоченных библиотек клонов. Карты контиг.
           Процедура “Прогулка по хромосоме”. . . . . . . . . . . . . . . . . . . .                               30
    1.4.3. Стратегии построения физической карты высокого
           разрешения . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .         30
  1.5. Определение нуклеотидной последовательности генома
      (секвенирование) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .          34
  1.6. Базы данных нуклеотидных последовательностей.
    Компьютерная генетика (биоинформатика). Исследования in silico .                                              37
  1.7. Кандидатное картирование . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .                   39
2. ГЕНОМИКА, ПРОТЕОМИКА И “ОБРАТНАЯ ГЕНЕТИКА”. . . . . . .                                                        40
  2.1. Геномика . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .     40
  2.2. Ортологичные и паралогичные гены . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .                           42
  2.3. “Обратная генетика” . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .              43
  2.4. Протеом и протеомика . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .               44
  2.5. ДНК-микрочипы (ДНК-поля) и примеры их использования для
       изучения геномов . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .           45
  2.6. Некоторые итоги сравнительного анализа геномов различных
       организмов . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .     48
3. ОБЛАСТИ ПРИМЕНЕНИЯ РЕЗУЛЬТАТОВ КАРТИРОВАНИЯ
   ГЕНОМА . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .     51
  3.1. Геномная медицина. ДНК-диагностика. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .                              51
  3.2. Обнаружение мутаций при наследственных заболеваниях
       человека . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .   55
  3.3. Генетический паспорт и его значение . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .                        59
СЛОВАРЬ ТЕРМИНОВ . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .                  60
РЕКОМЕНДУЕМАЯ ЛИТЕРАТУРА . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .                                59