Картирование генома и обратная генетика. Буторина А.К - 63 стр.

                                  63
      Космида – вектор, объединяющий свойства плазмидного вектора и
вектора на основе фага λ. Имеет cos-сайты. Позволяет клонировать боль-
шие (до 45Кб) по сравнению с плазмидами фрагменты ДНК.
      Локус – место на хромосоме, где находится специфический ген.
      Маркерные экспрессируемые последовательности, EST (Expressed
sequence tag) – короткие маркерные последовательности, характерные для
каждого экспрессируемого гена человека. Позволяют изучать размеры,
разнообразие и транскрипционную активность экспрессирующихся генов
человека.
      Маркерный ген – ген с известной хромосомной локализацией,
имеющий четкое фенотипическое проявление (мутантный фенотип, фер-
ментативная активность и др.). Часто используется при проведении карти-
рования других генов.
      “Обратная” генетика – в отличие от классической генетики, изу-
чающей вначале признаки, а затем контролирующие их гены (при-
знак→ ген), идет в обратном направлении - от идентификации гена при от-
сутствии всякой информации о нем к изучению его функции
(ген→ признак).
      Олигонуклеотид – короткий (6-10 нуклеотидов) сегмент одноцепо-
чечной ДНК. Обычно получают химическим путем.
      Ортологичные гены (ортологи) – это гомологичные гены в геномах
разных организмов, которые произошли от одного гена в общем предко-
вом организме и сохранили одну и ту же функцию в процессе эволюции.
      Отжиг – процесс образования двухцепочечных молекул (ДНК-ДНК
или ДНК-РНК) из одиночных полинуклеотидных комплементарных цепей.
Это процесс восстановления (ренатурации) двухцепочечных молекул.
      Паралогичные гены (паралоги) – в отличие от ортологов паралогич-
ные гены возникают путем внутригеномных дупликаций и могут эволю-
ционировать с приобретением новых функций.
      Позиционное картирование – одна из стратегий идентификации гена
заболевания в отсутствие данных о продукте этого гена и каких-либо ге-
нов-кандидатов. Сначала определяют хромосомную локализацию (пози-
цию) гена. Затем получают геномные клоны, охватывающие картирован-
ный сайт (используя соответствующие маркеры), идентифицируют и ана-
лизируют присутствующие в них экзоны. Используя целый ряд методов
определяют, какой именно ген ответственен за данное заболевание.
      Полимеразная цепая реакция (ПЦР = PCR – polymerase chain reaction)
- метод амплификации специфического фрагмента ДНК с помощью термо-
стабильной ДНК-полимеразы, с использованием олигонуклеотидных ДНК-
затравок, комплементарных последовательностям противоположных цепей
ДНК на границах амплифицируемого участка. Процесс состоит из серии
циклических повторяющихся реакций: денатурации ДНК, отжига зондов,
синтеза ДНК.
      Полиморфизм длины рестрикционных фрагментов, ПДРФ (restriction
fragment length polymorphism, RFLP) Изменчивость длины фрагментов