Составители:
Рубрика:
41
Äàííàÿ ïðîãðàììà ìîæåò ìîäåëèðîâàòü ñëó÷àéíûå èçìåíåíèÿ ÷àñòîò
àëëåëåé îäíîâðåìåííî â 6 íåçàâèñèìûõ äèàëëåëüíûõ ëîêóñàõ ïðè ðàç-
ëè÷íûõ íà÷àëüíûõ ÷àñòîòàõ àëëåëåé è ðàçíîé âåëè÷èíå ïîïóëÿöèè. Â
ñëó÷àå êîíå÷íîé âåëè÷èíû ïîïóëÿöèè ôèêñàöèÿ îäíîé èç àëëåëåé â êîíöå
êîíöîâ ïðîèçîéäåò âî âñåõ ëîêóñàõ, îäíàêî ñêîðîñòü ýòîãî ïðîöåññà î÷åíü
ñèëüíî çàâèñèò êàê îò âåëè÷èíû ïîïóëÿöèè, òàê è îò íà÷àëüíûõ ÷àñòîò
àëëåëåé. Òàê, ïðè p = 0.9 âåðîÿòíîñòü ôèêñàöèè àëëåëè A çíà÷èòåëüíî
âûøå è ýòî ïðîèçîéäåò ñêîðåå, ÷åì ïðè p = 0.5.
Ïðàêòè÷åñêàÿ ðàáîòà ñ ìîäåëüþ
Ïîÿñíåíèÿ ê îêíó ââîäà ïàðàìåòðîâ ìîäåëè
Please enter values for the – Ïîæàëóéñòà, ââåäèòå çíà÷åíèÿ:
Population Size (N) – Âåëè÷èíà ïîïóëÿöèè – Îñòàåòñÿ ïîñòîÿííîé â
òå÷åíèå âñåãî ïðîöåññà (çíà÷åíèÿ îò 1 äî 200).
Number of Loci to Simulate – ×èñëî ëîêóñîâ äëÿ ìîäåëèðîâàíèÿ – îò 1
äî 6. Ëó÷øå èñïîëüçîâàòü ââåäåííóþ ïî óìîë÷àíèþ âåëè÷èíó 6.
Set initial frequencies at all six loci collectively or independently – Óñòàíî-
âèòü íà÷àëüíûå ÷àñòîòû àëëåëåé âî âñåõ 6 ëîêóñàõ îäíîâðåìåí-
íî èëè íåçàâèñèìî. Êàê ïðàâèëî, áîëåå óäîáíûì ÿâëÿåòñÿ ïåðâûé
âàðèàíò ðàáîòû ìîäåëè, êîãäà âî âñåõ ëîêóñàõ íà÷àëüíûå ÷àñòîòû
àëëåëåé îäèíàêîâû. Âûáðàâ òîò èëè èíîé ðåæèì ðàáîòû, ââåäèòå
îäíî èëè 6 çíà÷åíèé ÷àñòîòû p àëëåëè A (Initial Frequency of “A”
Genes at Locus 1, Locus 2 ... Locus 6). Îíè ìîãóò ïðèíèìàòü ëþáûå
çíà÷åíèÿ â èíòåðâàëå îò 0 äî 1.
Permit selfing? Yes – No – Ðàçðåøåíî ëè ñàìîîïëîäîòâîðåíèå? Äà –
Íåò. Â ïåðâîì ðåæèìå ìîäåëèðîâàíèÿ ïðè îáðàçîâàíèè çèãîò
áóäóò èñïîëüçîâàíû âñå ãàìåòû, à âî âòîðîì – òîëüêî ãàìåòû,
ïðîäóöèðîâàííûå ðàçíûìè îñîáÿìè.
Set runtime to 3N generations or specify an alternate value – Óñòàíîâèòü
âðåìÿ ðàáîòû ðàâíîå 3N ïîêîëåíèé, èëè æå èñïîëüçîâàòü èíóþ
âåëè÷èíó. Êàê ïðàâèëî, äëÿ íàáëþäåíèÿ ýôôåêòîâ äðåéôà áûâàåò
äîñòàòî÷íî óñòàíîâëåííîãî ïî óìîë÷àíèþ âðåìåíè, ðàâíîãî 3N
ïîêîëåíèé, ïîñêîëüêó ñîãëàñíî òåîðèè äðåéôà ñðåäíåå ÷èñëî
ïîêîëåíèé, íåîáõîäèìîå äëÿ ôèêñàöèè èëè ïîòåðè àëëåëè ïðè
íà÷àëüíîé åå ÷àñòîòå p = 0.5, ñîñòàâëÿåò 2.8N. Ñëåäîâàòåëüíî, ïðè
òàêîì âðåìåíè ìîäåëèðîâàíèÿ ôèêñàöèÿ èëè ïîòåðÿ àëëåëè ïðîè-
çîéäåò â áîëüøèíñòâå, íî íå îáÿçàòåëüíî âî âñåõ ëîêóñàõ. Âû
ìîæåòå, îäíàêî, óñòàíîâèòü áîëüøåå èëè ìåíüøåå âðåìÿ ðàáîòû
ìîäåëè, â çàâèñèìîñòè îò ðåøàåìîé çàäà÷è. Ìàêñèìàëüíîå çíà÷å-
íèå – 999.
Страницы
- « первая
- ‹ предыдущая
- …
- 40
- 41
- 42
- 43
- 44
- …
- следующая ›
- последняя »
