Составители:
Рубрика:
47
Èññëåäîâàíèå ìîäåëè
Çäåñü, êàê è â áàçîâîé ìîäåëè äðåéôà, êàæäûé öèêë ìîäåëèðîâàíèÿ
ñ îäíèìè è òåìè æå ïàðàìåòðàìè äàåò èíûå ðåçóëüòàòû âñëåäñòâèå ñòî-
õàñòè÷íîñòè ïðîöåññà. Ïîýòîìó, èññëåäóÿ êàæäóþ ñèòóàöèþ, âû äîëæíû
çàïóñêàòü ïðîãðàììó ìíîãîêðàòíî (íå ìåíåå 10 ðàç), êàæäûé ðàç çàïèñû-
âàÿ ïîëó÷åííûé ðåçóëüòàò, à çàòåì óæå äåëàòü âûâîäû àíàëèçèðóÿ âñþ
âûáîðêó ïðîâåäåííûõ èñïûòàíèé.
1. Ðåêîìåíäóåì íà÷àòü ðàáîòó ñ ïàðàìåòðàìè, óñòàíîâëåííûìè ïî
óìîë÷àíèþ. Îíè âîñïðîèçâîäÿò íåóñòîé÷èâóþ ñèòóàöèþ, â êîòîðîé ïîáå-
æäàåò òî äðåéô, òî îòáîð. Çàïóñòèâ ïðîãðàììó ìíîãîêðàòíî, âû óáåäèòåñü
â ýòîì è ñìîæåòå âåñòè ñ÷åò “ïîáåäàì” è “ïîðàæåíèÿì” îáåèõ ñèë. Êàê è
ïî÷åìó èçìåíÿåòñÿ ýòîò “ñ÷åò” ïðè óìåíüøåíèè è óâåëè÷åíèè ÷èñëà
ïîêîëåíèé? Ïî÷åìó âñåãäà ïðîèñõîäèò ïîòåðÿ àëëåëè A? Êàê äîáèòüñÿ
ïðîòèâîïîëîæíîãî ðåçóëüòàòà? Ñêîëüêî â ñðåäíåì ïðîõîäèò ïîêîëåíèé
äî ôèêñàöèè àëëåëè è îò ÷åãî ýòî çàâèñèò?
2. Òåïåðü ïåðåéäèòå ê ñèììåòðè÷íîé ñèòóàöèè, êîãäà ïðèñïîñîáëåí-
íîñòè îáåèõ ãîìîçèãîò îäèíàêîâû. Èññëåäóéòå åå, èñïîëüçóÿ ðàçëè÷íûå
çíà÷åíèÿ ïðèñïîñîáëåííîñòè ãîìîçèãîò (íàïðèìåð, 0.9, 0.8, 0.5, 0.2, 0.1,
0.01, 0.001) âî âñåì âîçìîæíîì èíòåðâàëå çíà÷åíèé âåëè÷èíû ïîïóëÿöèè
îò 1 äî 1000 (íàïðèìåð, 5, 10, 25, 50, 100, 250, 500, 1000). Ïðè ýòîì êàæ-
äûé ðàç çàïèñûâàéòå ââåäåííûå ïàðàìåòðû è ïîëó÷åííûå ðåçóëüòàòû.
Âàøà îñíîâíàÿ çàäà÷à – ïðîâåðèòü ñïðàâåäëèâîñòü “ïðàâèëà Êèìóðû” è
ïîäòâåðäèòü ýòî ïîëó÷åííûìè öèôðîâûìè äàííûìè.
3. Èññëåäóéòå âëèÿíèå íà õîä ïðîöåññà èñõîäíîé ÷àñòîòû àëëåëè A
(íàïðèìåð, 0.1, 0.5, 0.9) â òîé æå ñèììåòðè÷íîé ñèòóàöèè. Ïîäõîäÿùàÿ
äëÿ ýòîãî âåëè÷èíà ïîïóëÿöèè – 50 îñîáåé. Èçìåíÿåòñÿ ëè âåðîÿòíîñòü
ôèêñàöèè èëè ïîòåðè àëëåëè â çàâèñèìîñòè îò åå èñõîäíîé ÷àñòîòû? Êàê
âëèÿåò íà ýòî èíòåíñèâíîñòü îòáîðà?
12. Èíáðèäèíã
(Inbreeding)
Ïðîãðàììà ìîäåëèðóåò äåéñòâèå èíáðèäèíãà â ñî÷åòàíèè ñ ãåíåòè÷åñ-
êèì äðåéôîì â ïîïóëÿöèè êîíå÷íîãî ðàçìåðà ïðè ïîëíîì îòñóòñòâèè
îòáîðà. Äëÿ ìîäåëèðîâàíèÿ äðåéôà èñïîëüçîâàí ìåòîä Ìîíòå Êàðëî.
Êàê èçâåñòíî, áëèçêîðîäñòâåííîå ñêðåùèâàíèå, ïðèâîäèò ê ãîìîçèãî-
òèçàöèè è ïîòåðå ãåíåòè÷åñêîé èçìåí÷èâîñòè. Äëÿ êîëè÷åñòâåííîé îöåíêè
ýòîãî ïðîöåññà èñïîëüçóþò êîýôôèöèåíò èíáðèäèíãà F, îïðåäåëÿåìûé
êàê âåðîÿòíîñòü òîãî, ÷òî ïðè îáðàçîâàíèè çèãîòû î÷åðåäíîãî ïîêîëåíèÿ
â îäíîì èç åå ëîêóñîâ îêàæóòñÿ àëëåëè, èäåíòè÷íûå ïî ïðîèñõîæäåíèþ,
ò.å. ïîÿâèâøàÿñÿ îñîáü áóäåò ïî äàííîìó ëîêóñó àóòîçèãîòíîé.
Страницы
- « первая
- ‹ предыдущая
- …
- 46
- 47
- 48
- 49
- 50
- …
- следующая ›
- последняя »
