Составители:
Рубрика:
4
äàëåå äî “Z”; ÷èñëî 27 ñîîòâåòñòâóåò “ïðîáåëó”. Ñîñòàâëåííàÿ òàêèì
îáðàçîì ôðàçà ñòàíîâèòñÿ “ðîäèòåëüñêîé” äëÿ ñëåäóþùåãî ïîêîëåíèÿ.
(á) Òåïåðü èñõîäíàÿ ðîäèòåëüñêàÿ ôðàçà ïðîèçâîäèò íåêîòîðîå êîëè÷åñ-
òâî ïîòîìêîâ – “âûâîäîê”. Ïî óìîë÷àíèþ ðàçìåð ýòîãî âûâîäêà – 50
îñîáåé, íî âû ìîæåòå óñòàíîâèòü è äðóãóþ âåëè÷èíó. Äëÿ òîãî, ÷òîáû
ïðîèçâåñòè êàæäîãî “ïîòîìêà”, ïðîãðàììà êîïèðóåò èñõîäíóþ ôðàçó, íî
â ïðîöåññå ýòîãî êîïèðîâàíèÿ âîçíèêàþò “ìóòàöèè”. Äëÿ êàæäîãî çíàêà â
ðîäèòåëüñêîé ôðàçå Populus ãåíåðèðóåò ñëó÷àéíîå ÷èñëî â èíòåðâàëå îò
0 äî 1 è ñðàâíèâàåò åãî ñ çàäàííîé ïîëüçîâàòåëåì “÷àñòîòîé ìóòàöèé”.
Ýòî ñðàâíåíèå îïðåäåëÿåò, ñîõðàíèòñÿ ëè â äàííîé ïîçèöèè ïðåæíÿÿ
áóêâà, èëè æå åå çàìåíèò íîâàÿ, ñëó÷àéíî âûáðàííàÿ ñðåäè òåõ æå 27
çíàêîâ. Íàïðèìåð, åñëè ÷àñòîòà ìóòàöèé ñîñòàâëÿåò 0.1, à ñëó÷àéíîå
÷èñëî îêàçàëîñü áîëüøå ýòîé âåëè÷èíû, Populus ñîõðàíèò â äàííîì ìåñòå
ïðåæíþþ áóêâó, åñëè æå ñëó÷àéíîå ÷èñëî ìåíüøå 0.1, ôðàçà-ïîòîìîê
ïîëó÷èò èíóþ “ìóòàíòíóþ” áóêâó, âûáðàííóþ â ñëó÷àéíîì ïîðÿäêå, êàê ýòî
áûëî îïèñàíî âûøå. Òàê âîçíèêàåò íîâàÿ ôðàçà – “ïîòîìîê” èñõîäíîé.
Ïðîöåññ ïîâòîðÿåòñÿ ñòîëüêî ðàç, ñêîëüêî íåîáõîäèìî äëÿ ïðîäóöèðîâà-
íèÿ âñåãî âûâîäêà.
(â) Íà ñëåäóþùåì ýòàïå âåñü âûâîäîê ïîòîìêîâ ïîäâåðãàåòñÿ “åñòåñòâåí-
íîìó îòáîðó”. Populus ïîñëåäîâàòåëüíî ñðàâíèâàåò âñå ôðàçû âûâîäêà
ñ çàäàííîé àâòîðîì èñêîìîé ôðàçîé “METHINKS IT IS LIKE A WOOSLE”,
è âûáèðàåò òó èç íèõ, êîòîðàÿ â íàèáîëüøåé ñòåïåíè (ò.å. ïî íàèáîëüøåìó
÷èñëó ïîçèöèé) ñîâïàäàåò ñ èñêîìîé. Ýòà îòîáðàííàÿ ôðàçà è ñòàíîâèòñÿ
ðîäèòåëüñêîé äëÿ ñëåäóþùåãî ïîêîëåíèÿ, ò.å. ïðîèçâîäèò íîâûé âûâîäîê
â ñîîòâåòñòâèè ñ îïèñàííîé âûøå ñõåìîé.
(ã) Populus ïîâòîðÿåò âåñü ïðîöåññ äî òåõ ïîð, ïîêà öåëü íå áóäåò äîñ-
òèãíóòà, ò.å. íå îáðàçóåòñÿ çàäàííàÿ ôðàçà.
Ïîìèìî ìóòàöèé è îòáîðà, â ïðîãðàììå ïðåäóñìîòðåíà òàêæå âîçìîæ-
íîñòü èñïîëüçîâàíèÿ åùå îäíîé ýâîëþöèîííîé ñèëû – ðåêîìáèíàöèè. Îíà
âêëþ÷àåòñÿ â ïðîöåññ “ýâîëþöèè” â òîì ñëó÷àå, åñëè âû ââåäåòå çíà÷åíèå
ïàðàìåòðà ÷àñòîòû ðåêîìáèíàöèè (“Recombination Fraction”) áîëüøå íóëÿ
(ñì. íèæå).  ýòîì ñëó÷àå Populus êàæäûé ðàç ãåíåðèðóåò äâå ðîäèòå-
ëüñêèå ôðàçû – P1 è P2. Ñëó÷àéíî âûáðàâ îäíó èç íèõ, ïðîãðàììà
íà÷èíàåò îïèñàííûé âûøå ïðîöåññ êîïèðîâàíèÿ (òðàíñêðèïöèè). Íî íà
ýòîò ðàç Populus ãåíåðèðóåò äâà ñëó÷àéíûõ ÷èñëà âìåñòî îäíîãî äëÿ
êàæäîé ïîçèöèè ôðàçû. Ïåðâîå èç íèõ ïðîãðàììà ñðàâíèâàåò ñî çíà-
÷åíèåì ïàðàìåòðà ÷àñòîòû ðåêîìáèíàöèè. Åñëè ñëó÷àéíîå ÷èñëî îêà-
çûâàåòñÿ áîëüøå ýòîãî ïàðàìåòðà, òî ïðîöåññ êîïèðîâàíèÿ ïðîäîëæàåòñÿ
îáû÷íûì ïóòåì, åñëè æå ñëó÷àéíîå ÷èñëî ìåíüøå ÷àñòîòû ðåêîìáèíàöèè,
òî ïðîãðàììà ïåðåõîäèò ê ñîîòâåòñòâóþùåé ïîçèöèè âî âòîðîé ðî-
äèòåëüñêîé ôðàçå è ïðîäîëæàåò ïðîöåññ òðàíñêðèïöèè óæå ñ íåå äî òåõ
ïîð, ïîêà íîâîå ñëó÷àéíîå ÷èñëî íå âûçîâåò ñëåäóþùèé “êðîññèíãîâåð”
– ïåðåõîä ê ïåðâîé ðîäèòåëüñêîé ôðàçå, è òàê äàëåå. Âòîðîå ñëó÷àéíîå
Страницы
- « первая
- ‹ предыдущая
- …
- 3
- 4
- 5
- 6
- 7
- …
- следующая ›
- последняя »
