Компьютерное моделирование. Клюев С.А. - 56 стр.

UptoLike

ВУЗ: 

ВПИ ВолгГТУ | Волжский

Составители: 

Рубрика: 

56
Перенос протона и специфика водородных связей (-N
+
H
3
...
-
OOC- и -NH
2
...HOOC-)
рассматривались в рамках теории активированного комплекса. Имеется в виду
последовательный перенос протона на три азотсодержащие единицы. Во многих белках
пирролохинолин хинон взаимодействует с кальцием, что можно также смоделировать
полуэмпирическими методами.
Разработан метод моделирования на основе теории функционала плотности (ТФП, англ. -
DTF). Согласно этой теории, все электронные свойства системы, включая энергию, могут
быть получены из электронной плотности (без знания волновых функций). Применяют два
типа ТФП: приближение локальной плотности, где предполагается, что локально электронная
плотность систем может быть описана как электронная плотность однородного электронного
газа, и приближение локальной спиновой плотности, где электронная плотность разделяется
на плотность электронов со спинами α и β. Электронная плотность – мера «плотности»
электронного облака в данном месте, плотность вероятности присутствия электронов.
Функция определена во всем пространстве. Интеграл от электронной плотности по всему
пространству дает полное число электронов. Кинетическая энергия электронов описывается
явно в приближении независимых частиц, классическая часть потенциальной энергии
описывается по закону Кулона. Обмен и электронная корреляция учитываются приближенно.
Электронная корреляция – эффект, обусловленный мгновенным кулоновским отталкиванием
между электронами (стремлением электронов «избежать друг друга»). Его учет приводит к
более низкому значению полной энергии системы. Указанный эффект не учитывается в
методе Хартри-Фока. Изменение энергии, вызванное этими мгновенными кулоновскими
взаимодействиями, называется энергией корреляции: E
корреляц.
= E
точн.
- E
ХФ
< 0. Учет
электронной корреляции особенно важен при исследовании эффектов, зависящих от
возбужденных состояний или плохо описываемых в однодетерминантном приближении. 
Перенос протона и специфика водородных связей (-N+H3...-OOC- и -NH2...HOOC-)

рассматривались   в   рамках   теории   активированного   комплекса.   Имеется   в   виду

последовательный перенос протона на три азотсодержащие единицы. Во многих белках

пирролохинолин хинон взаимодействует с кальцием, что можно также смоделировать

полуэмпирическими методами.

 Разработан метод моделирования на основе теории функционала плотности (ТФП, англ. -

DTF). Согласно этой теории, все электронные свойства системы, включая энергию, могут

быть получены из электронной плотности (без знания волновых функций). Применяют два

типа ТФП: приближение локальной плотности, где предполагается, что локально электронная

плотность систем может быть описана как электронная плотность однородного электронного

газа, и приближение локальной спиновой плотности, где электронная плотность разделяется

на плотность электронов со спинами α и β. Электронная плотность – мера «плотности»

электронного облака в данном месте, плотность вероятности присутствия электронов.

Функция определена во всем пространстве. Интеграл от электронной плотности по всему

пространству дает полное число электронов. Кинетическая энергия электронов описывается

явно в приближении независимых частиц, классическая часть потенциальной энергии

описывается по закону Кулона. Обмен и электронная корреляция учитываются приближенно.

Электронная корреляция – эффект, обусловленный мгновенным кулоновским отталкиванием

между электронами (стремлением электронов «избежать друг друга»). Его учет приводит к

более низкому значению полной энергии системы. Указанный эффект не учитывается в

методе Хартри-Фока. Изменение энергии, вызванное этими мгновенными кулоновскими

взаимодействиями, называется энергией корреляции: Eкорреляц. = Eточн. - EХФ < 0. Учет

электронной корреляции особенно важен при исследовании эффектов, зависящих от

возбужденных состояний или плохо описываемых в однодетерминантном приближении.


                                           56

Страницы