Количественный анализ биологических данных. Малков П.Ю. - 49 стр.

UptoLike

Составители: 

48
0.0 0.1 0.2 0.3 0.4 0.5
s8
s7
s6
s5
s4
s3
s2
s1
Рис. 9. Пример дендрограммы, построенной на основе матрицы
мер различия (1–r) методомближайшего соседа.
Другим средством, позволяющим упорядочить вторичную мат-
рицу, является метод корреляционных плеяд, в первоначальном
виде предложенный П. В. Тереньтевым [1959, 1960; Терентьев,
Ростова, 1977].
S
2
S
4
S
3
5
S
6
S
1
S
7
S
8
71
56
58
54
60
73
80
45
69
66
54
56
Рис. 10. Пример неориентированного графа сходства, построенно-
го на основе матрицы коэффициентов Жаккара. Порог сходства
равен 45 % (средний уровень сходства во вторичной матрице).
Суть данного метода состоит в построении графов, то есть
схем, где объекты изображены в виде точек (или других значков),
часть из которых соединяется линиями - рёбрами графа. При этом
рёбра графа соединяют только те объекты, связь между которыми
превосходит заранее определенный порог сходства. Степень соот-
ветствия между объектами, как правило, отражается характером
взаимного расположения точек, то есть чем больше уровень сход-
ства или корреляции между объектами, тем ближе на графе они
расположены друг к другу. Иногда отличия в уровне связи пока-
зывают при помощи толщины рёбер графа и т.п. На рисунке 10 в
качестве примера представлен граф сходства, построенный на ос-
     s1


     s2


     s3


     s4


     s5


     s6


     s7


     s8



      0.0         0.1              0.2             0.3             0.4   0.5

Рис. 9. Пример дендрограммы, построенной на основе матрицы
мер различия (1–r) методом “ближайшего соседа”.

   Другим средством, позволяющим упорядочить вторичную мат-
рицу, является метод корреляционных плеяд, в первоначальном
виде предложенный П. В. Тереньтевым [1959, 1960; Терентьев,
Ростова, 1977].

     71           56                   54           80
S1          S2               S4               S6         S7


             58    66    54              56        60         73

                                                         S8
                  S3
                                  S5          45
                        69
Рис. 10. Пример неориентированного графа сходства, построенно-
го на основе матрицы коэффициентов Жаккара. Порог сходства
равен 45 % (средний уровень сходства во вторичной матрице).

   Суть данного метода состоит в построении графов, то есть
схем, где объекты изображены в виде точек (или других значков),
часть из которых соединяется линиями - рёбрами графа. При этом
рёбра графа соединяют только те объекты, связь между которыми
превосходит заранее определенный порог сходства. Степень соот-
ветствия между объектами, как правило, отражается характером
взаимного расположения точек, то есть чем больше уровень сход-
ства или корреляции между объектами, тем ближе на графе они
расположены друг к другу. Иногда отличия в уровне связи пока-
зывают при помощи толщины рёбер графа и т.п. На рисунке 10 в
качестве примера представлен граф сходства, построенный на ос-

                                                   48