ВУЗ:
Составители:
Рубрика:
41
4.2.1. Полная энергия и среднеквадратический градиент
Пункт Single Point (Одноточечный расчет) запускает вычисление полной
энергии в ккал/моль и среднеквадратического градиента (root-mean-square
(RMS) gradient) в ккал/моль/Å энергии системы или ее выделенных
элементов . В точке локального минимума среднеквадратическое градиента
близко к нулю. С полуэмпирическими, неэмпирическими и плотностно-
функциональными вычислениями также вычисляется электронное и зарядовое
распределение в системе. Одноточечный расчет означает расчет для одной
точки на потенциально-энергетической поверхности.
4.2.2. Оптимизация геометрии
Диалоговое окно запуска оптимизации геометрии одинаково для
молекулярной механики, полуэмпирических и неэмпирических методов :
Рис.34. Диалоговое окно запуска оптимизации геометрии
В блоке Algorithm (Алгоритм ) задаются методы сходимости для
минимизации энергии системы оптимизацией ее геометрии:
• Steepest Descent (Метод наискорейшего спуска). Процесс сходимости
осуществляется по спуску на поверхности энергии. Если энергия
уменьшается , то шаг оптимизации геометрии увеличивается , иначе –
шаг уменьшается . Этот метод в основном применяется для первичного
улучшения геометрии перед использованием более точных алгоритмов .
В некоторых случаях может наблюдаться отсутствие сходимости. Не
подходит для макромолекулярных систем .
• Fletcher-Reeves (Conjugate gradient) (Метод Флетчера- Ривса
( Сопряженных градиентов )). В этом методе направление сходимости
( т. е . cycle, цикл ) определяется выбором минимума из вычисленного
градиента, сопряженного к нему и градиента предыдущего шага.
Сходится быстрее, чем метод наискорейшего спуска.
41
4.2.1. П олная энерги я и среднеквадрати ч ески й гради ент
П унктSingle Point (О дноточечны й расчет) запускаетвы числ ение пол ной
энергии в ккал/моль и среднеквадратического градиента (root-mean-square
(RMS) gradient) в ккал/моль/Å энергии системы ил и ее вы дел енны х
эл ементов. В точке л окал ьного минимума среднеквадратическое градиента
бл изко к нул ю . С пол уэмпирическими, неэмпирическими и пл отностно-
ф ункционал ьны ми вы числ ения ми такж е вы числ я ется эл ектронное и заря довое
распредел ение в системе. О дноточечны й расчет означает расчет дл я одной
точки напотенциал ьно-энергетической поверхности.
4.2.2. О пти ми заци я геометри и
Д иал оговое окно запуска оптимизации геометрии одинаково дл я
мол екул я рной механики, пол уэмпирическихи неэмпирических методов:
Рис.34. Д иал оговое окнозапускаоптимизации геометрии
В бл оке Algorithm (Ал горитм) задаю тся методы сходимости дл я
минимизации энергии системы оптимизацией ее геометрии:
• Steepest Descent (Метод наискорейш егоспуска). П роцесс сходимости
осущ ествл я ется по спуску на поверхности энергии. Е сл и энергия
уменьш ается , то ш аг оптимизации геометрии увел ичивается , иначе –
ш аг уменьш ается . Э тот метод в основном применя ется дл я первичного
ул учш ения геометрии перед испол ьзованием бол ее точны х ал горитмов.
В некоторы х сл учая х мож ет набл ю даться отсутствие сходимости. Н е
подходитдл я макромол екул я рны х систем.
• Fletcher-Reeves (Conjugate gradient) (Метод Ф л етчера-Ривса
(С опря ж енны х градиентов)). В этом методе направл ение сходимости
(т.е. cycle, цикл ) определ я ется вы бором минимума из вы числ енного
градиента, сопря ж енного к нему и градиента преды дущ его ш ага.
С ходится бы стрее, чем метод наискорейш егоспуска.
