Математическое моделирование структуры соединений с помощью пакета программ Hyperchem 7.5. Резников А.А - 42 стр.

UptoLike

Рубрика: 

42
Polak-Ribiere (Conjugate gradient) (Метод Полака- Рибьера
( Сопряженных градиентов )). Является усовершенствованием
предыдущего метода: сходится быстрее, но требует больше памяти.
Eigenvector following. Применяется только в полуэмпирических и
неэмпирических расчетах. Использует собственные векторы
диагонализованной матрицы Гессе (матрица вторых производных
общей энергии по смещениям атомов ) для выбора оптимальных
сдвигов атомов . Может успешно применяться для систем , геометрия
которых далека от минимума.
Block-diagonal Newton-Raphson (Блок - диагональный метод Ньютона-
Рафсона). Используется только в молекулярно-механических расчетах.
Единственный метод , аналитически рассчитывающий вторые
производные энергии по ее геометрическим параметрам . Очень сильно
зависит от правильности стартовой геометрии системы . В некоторых
случаях может наблюдаться отсутствие сходимости.
Conjugate Directions (Метод сопряженных направлений ). Является
новым оптимизационным методом , не требующим вычислений
градиентов (первых производных). Если процесс не сходится , то
рекомендуется его повторный запуск.
Блок Termination Condition (Условия остановки) включает в себя поля:
RMS gradient of (Среднеквадратическое градиента). Характеризует
силы , действующие на атомы . Т .к. силы являются первыми
производными энергии по координатам атома, то этот параметр имеет
размерность ккал /(моль*Å). В расчетах он обычно задается в пределах
от 10
-3
до 0.1. Величины менее 10
-3
не всегда достижимы , так как
систематическая ошибка расчетов достигает примерно такой же
величины . В результате расчетов будет достигнут один из локальных
минимумов , который совсем не обязательно окажется глобальным.
Maximum cycles (Максимальное число циклов ). В расчетах этот
параметр обычно задается в пределах от 100 до 1000.
Остановка расчета произойдет при достижении одного из условий .
Также в блоке Options (Настройки) есть пункт In vacuo (лат. - в
пустоте ), выделив который сбрасываются все периодические граничные
условия расчетов .
В поле Screen refresh period (Период обновления изображения на
экране) задается частота обновления в зависимости от числа циклов
оптимизации. Может принимать значение от 1 до 32767.
Литература
1. HyperChem Release 7 for Windows Help.
2. Кларк Т . Компьютерная химия / Т .Кларк. - М.: Мир, 1990. - 383 с.
                                          42
    • Polak-Ribiere      (Conjugate     gradient)       (Метод П ол ака-Рибьера
      (С опря ж енны х    градиентов)).      Я вл я ется    усоверш енствованием
      преды дущ егометода: сходится бы стрее, нотребуетбол ьш е памя ти.
    • Eigenvector following. П рименя ется тол ько в пол уэмпирических и
      неэмпирических расчетах.          И спол ьзует собственны е векторы
      диагонал изованной матрицы Г ессе (матрица вторы х производны х
      общ ей энергии по смещ ения м атомов) дл я вы бора оптимал ьны х
      сдвигов атомов. Мож ет успеш но применя ться дл я систем, геометрия
      которы хдал екаотминимума.
    • Block-diagonal Newton-Raphson (Бл ок-диагонал ьны й метод Н ью тона-
      Раф сона). И спол ьзуется тол ьков мол екул я рно-механических расчетах.
      Е динственны й метод, анал итически рассчиты ваю щ ий               вторы е
      производны е энергии поее геометрическим параметрам. О чень сил ьно
      зависит от правил ьности стартовой геометрии системы . В некоторы х
      сл учая х мож етнабл ю даться отсутствие сходимости.
    • Conjugate Directions (Метод сопря ж енны х направл ений). Я вл я ется
      новы м оптимизационны м методом, не требую щ им вы числ ений
      градиентов (первы х производны х). Е сл и процесс не сходится , то
      рекомендуется егоповторны й запуск.
     Бл окTermination Condition (У сл овия остановки) вкл ю чаетв себя пол я :
    • RMS gradient of (С реднеквадратическое градиента). Характеризует
      сил ы , дей ствую щ ие на атомы . Т .к. сил ы я вл я ю тся первы ми
      производны ми энергии покоординатам атома, тоэтот параметр имеет
      размерность ккал /(мол ь*Å). В расчетах он обы чнозадается в предел ах
      от 10-3 до 0.1. В ел ичины менее 10-3 не всегда достиж имы , так как
      систематическая ош ибка расчетов достигает примерно такой ж е
      вел ичины . В резул ьтате расчетов будет достигнут один из л окал ьны х
      минимумов, которы й совсем не обя зател ьноокаж ется гл обал ьны м.
    • Maximum cycles (Максимал ьное числ о цикл ов). В расчетах этот
      параметр обы чнозадается в предел ахот100 до1000.

      О становкарасчетапроизойдетпри достиж ении одногоиз усл овий.
      Т акж е в бл оке Options (Н астройки) есть пункт In vacuo (л ат. - в
пустоте), вы дел ив которы й сбрасы ваю тся все периодические граничны е
усл овия расчетов.
      В пол е Screen refresh period (П ериод обновл ения изображ ения на
экране) задается частота обновл ения в зависимости от числ а цикл ов
оптимизации. Мож етпринимать значение от1 до32767.



                                  Л и тература
    1. HyperChem Release 7 for Windows Help.
    2. Кл аркТ . К омпью терная химия / Т .Кл арк. - М.: Мир, 1990. - 383 с.