Картирование генома и обратная генетика. Буторина А.К - 38 стр.

                                  38
довательностей нуклеотидов генома человека в ней хранится вся получен-
ная информация о генетических маркерах, зондах и контигах, ассоцииро-
ванных с генетическими заболеваниями.
       Четыре других базы данных хранят все известные последовательно-
сти нуклеотидов, включая последовательности нуклеотидов генома чело-
века: GenBank и Genome Sequence Data Base (GSDB) в США; European
Molecular Biology Laboratory (EMBL) в Европе, International Nucleotide
Sequense Database (INSD) в Великообритании; DNA Data Bank of Japan
(DDBJ) в Японии. В России Институтом молекулярной биологии им. В.А.
Энгельгардта поддерживается аналогичная база данных по геному челове-
ка (Hugene). Банки постоянно обмениваются данными и в этом смысле,
практически равноценны. В этих базах данных в 1996 году хранилось
∼200 млн.пн, предоставленных как самими авторами, так и вводимых из
статей, опубликованных в периодических изданиях.
       Основной международной базой данных по последовательностям
аминокислот является Protein Identification Resource (Швейцария).
       Компьютерная генетика (биоинформатика). Исследования in
silico. Автоматизация процесса секвенирования, лавинообразное нараста-
ние объема данных результатов секвенирования послужило толчком рож-
дения молодой науки – биоинформатики (вычислительной биологии), она
же компьютерная генетика. Эта наука возникла в 1976-1978 годах, окон-
чательно оформилась в 1980 году со специальным выпуском журнала
«Nucleic Acid Research» (NAR), посвященного биоинформатике. Затем бы-
ли предложены некоторые алгоритмы выравнивания последовательностей
(т.е. способа написания нескольких последовательностей друг под другом
для их дальнейшего сравнения). В 1987 году появился GeneBank (коллек-
ция нуклеотидных последовательностей) и т.д. Биоинформатика возникла
на стыке молекулярной биологии и генетики, математики (статистики и
теории вероятности) и информатики.
       Каждая полученная последовательность нуклеотидов представляет
интерес для целей генной инженерии и биотехнологии, сравнения с нук-
леотидными последовательностями других организмов. Компьютерный
анализ становится основным методом сравнения и изучения генов различ-
ных организмов, предсказания функции генов по нуклеотидной и амино-
кислотной последовательности и др. Биоинформатика стала чрезвычайно
модной областью науки, спрос на специалистов в которой очень велик.
       Биоинформатика решает следующие задачи:
       1. Статистический анализ последовательностей ДНК;
       2. Предсказание функции по последовательности (распознавание ге-
нов в последовательности ДНК, поиск регуляторных сигналов, предсказа-
ние функций белков).
       3. Анализ пространственной структуры белков и нуклеиновых ки-
слот, в том числе предсказание структуры белка по последовательности;
       4. Теория молекулярной эволюции и систематика.