Картирование генома и обратная генетика. Буторина А.К - 48 стр.

UptoLike

Рубрика: 

48
влиянием интерферона, что указывает важность интерферонового ответа
при заражении данным вирусом.
Используя микрочипы , можно диагностировать не только врожден-
ные заболевания, но и болезни, являющиеся результатом прижизненных
мутаций в генетическом коде. Так, в геноме человека есть два гена, кото-
рые в норме расположены достаточно далеко друг от друга. В результате
патологических перестроек в ДНК они могут оказаться по соседству. Этот
факт служит достоверным свидетельством начала лейкоза (рака крови).
Например, таким способом лейкоз выявляется на несколько лет раньше,
нежели стандартным путем. И многих людей можно было бы спасти,
пройдя они вовремя подобную проверку . С помощью микрочипов можно
диагностировать и различные подклассы острого лейкоза. Для этого ис -
пользуется микрочип, содержащий 50 генов, сильное различие экспрессии
которых позволяет однозначно определить тип опухоли и выбрать нужный
курс терапии.
Существенную помощь микрочипы могут оказать и при пересадке
органов, основной проблемой которой является отторжение имплантиро-
ванных тканей иммунной системой человека. Чтобы избежать отторжения,
необходимо, чтобы белки - маркеры гистосовместимости на имплантиро-
ванной ткани как можно меньше отличались от белков-маркеров пациента.
Подходящего донора (в качестве которого может выступать не только че -
ловек, но и клонированное животное , например, свинья), пересадка орга-
нов от которого вызвала бы минимальный иммунный ответ, можно подоб-
рать с помощью микрочипов.
Олигонуклеотидные микрочипы используют для секвенирования
(секвенирование гибридизацией). Это еще один (новый) подход, предло-
женный в 1988 г. группой российских ученых Института молекулярной
биологии им. В .А . Энгельгардта РАН под руководством А .Д . Мирзабекова.
Суть метода заключается в секвенировании коротких фрагментов ДНК пу-
тем гибридизации с олигонуклеотидами известной последовательности,
которые иммобилизованы на микрочипе в строго определенном порядке .
2.6. Некоторые итоги сравнительного анализа геномов
различных организмов
Коснемся лишь некоторых итогов сравнительного анализа полных
геномов различных организмов.
По данным секвенирования генома человека суммарное число генов,
кодирующих белки , составляет около 32 тысяч. Прежние оценки (80-100
тысяч) были завышены , так как характеризовали не число самих генов, а
разнообразие транскрибируемых с них молекул РНК.
Экспериментально (по функции продукта, наличию мутаций , разме -
ру транскрипта, тканеспецифичности и т.д.) охарактеризовано пока около
6500 генов человека, то есть примерно одна шестая часть . На основе гомо-
логии с известными генами других организмов в геномном сиквенсе чело-
                                  48
влиянием интерферона, что указывает важность интерферонового ответа
при заражении данным вирусом.
      Используя микрочипы, можно диагностировать не только врожден-
ные заболевания, но и болезни, являющиеся результатом прижизненных
мутаций в генетическом коде. Так, в геноме человека есть два гена, кото-
рые в норме расположены достаточно далеко друг от друга. В результате
патологических перестроек в ДНК они могут оказаться по соседству. Этот
факт служит достоверным свидетельством начала лейкоза (рака крови).
Например, таким способом лейкоз выявляется на несколько лет раньше,
нежели стандартным путем. И многих людей можно было бы спасти,
пройдя они вовремя подобную проверку. С помощью микрочипов можно
диагностировать и различные подклассы острого лейкоза. Для этого ис-
пользуется микрочип, содержащий 50 генов, сильное различие экспрессии
которых позволяет однозначно определить тип опухоли и выбрать нужный
курс терапии.
      Существенную помощь микрочипы могут оказать и при пересадке
органов, основной проблемой которой является отторжение имплантиро-
ванных тканей иммунной системой человека. Чтобы избежать отторжения,
необходимо, чтобы белки-маркеры гистосовместимости на имплантиро-
ванной ткани как можно меньше отличались от белков-маркеров пациента.
Подходящего донора (в качестве которого может выступать не только че-
ловек, но и клонированное животное, например, свинья), пересадка орга-
нов от которого вызвала бы минимальный иммунный ответ, можно подоб-
рать с помощью микрочипов.
      Олигонуклеотидные микрочипы используют для секвенирования
(секвенирование гибридизацией). Это еще один (новый) подход, предло-
женный в 1988 г. группой российских ученых Института молекулярной
биологии им. В.А. Энгельгардта РАН под руководством А.Д. Мирзабекова.
Суть метода заключается в секвенировании коротких фрагментов ДНК пу-
тем гибридизации с олигонуклеотидами известной последовательности,
которые иммобилизованы на микрочипе в строго определенном порядке.

        2.6. Некоторые итоги сравнительного анализа геномов
                       различных организмов

      Коснемся лишь некоторых итогов сравнительного анализа полных
геномов различных организмов.
      По данным секвенирования генома человека суммарное число генов,
кодирующих белки, составляет около 32 тысяч. Прежние оценки (80-100
тысяч) были завышены, так как характеризовали не число самих генов, а
разнообразие транскрибируемых с них молекул РНК.
      Экспериментально (по функции продукта, наличию мутаций, разме-
ру транскрипта, тканеспецифичности и т.д.) охарактеризовано пока около
6500 генов человека, то есть примерно одна шестая часть. На основе гомо-
логии с известными генами других организмов в геномном сиквенсе чело-