ВУЗ:
Составители:
Рубрика:
61
Работа 22. Определение вставки ДНК в трансформированных клетках
методом рестрикции
1.
Рестрикцию вставки ДНК можно проводить любой рестриктазой,
имеющей по одному сайту рестрикции с каждой стороны от вставки,
например, EcoR I.
2.
Собрать смесь для рестрикции:
10х ПЦР буфер для EcoR I – 1,5 мкл.
Плазмидная ДНК – 1 мкг.
Фермент EcoR I – 1 ед.
Деионизованная вода – до 15 мкл.
3.
Инкубировать смесь при 37
о
С 30 мин. Инактивировать фермент нагре-
ванием до 65
о
С на 20 мин.
Работа 23. Идентификация вставки ДНК в трансформированных
клетках методом ПЦР
1. При определении вставки можно использовать как секвенирующие
праймеры М13, так и специфические праймеры для ДНК вставки.
2.
В случае использования специфических праймеров для вставки ДНК,
программа и параметры амплификации используются соответствую-
щие.
3.
Если использовать праймеры М13, то программа для амплификации
следующая:
1)
Денатурация при 95
о
о
о
С 3 мин.
2)
Денатурация цикла при 95
о
С 30 с.
3)
Отжиг праймеров при 50
о
С 30 с.
4)
Элонгация цепи при 72
о
С 40 с.
5)
Повторить цикл амплификации с п. 2. по п. 4. 30 раз.
6)
Финальная элонгация при 72
о
С 3 мин.
Работа 22. Определение вставки ДНК в трансформированных клетках методом рестрикции 1. Рестрикцию вставки ДНК можно проводить любой рестриктазой, имеющей по одному сайту рестрикции с каждой стороны от вставки, например, EcoR I. 2. Собрать смесь для рестрикции: 10х ПЦР буфер для EcoR I 1,5 мкл. Плазмидная ДНК 1 мкг. Фермент EcoR I 1 ед. Деионизованная вода до 15 мкл. 3. Инкубировать смесь при 37 оС 30 мин. Инактивировать фермент нагре- ванием до 65 оС на 20 мин. Работа 23. Идентификация вставки ДНК в трансформированных клетках методом ПЦР 1. При определении вставки можно использовать как секвенирующие праймеры М13, так и специфические праймеры для ДНК вставки. 2. В случае использования специфических праймеров для вставки ДНК, программа и параметры амплификации используются соответствую- щие. 3. Если использовать праймеры М13, то программа для амплификации следующая: оо 1) Денатурация при 95 оС 3 мин. 2) Денатурация цикла при 95 оС 30 с. 3) Отжиг праймеров при 50 оС 30 с. 4) Элонгация цепи при 72 оС 40 с. 5) Повторить цикл амплификации с п. 2. по п. 4. 30 раз. 6) Финальная элонгация при 72 оС 3 мин. 61