Составители:
Рубрика:
52
Heterozygote Advantage Mode (Ïðåèìóùåñòâî ãåòåðîçèãîò); Local
Het – Local Heterozygote Advantage Mode (Ëîêàëüíîå ïðåèìóùåñòâî
ãåòåðîçèãîò); Freq Dpdnt – Frequency Dependent Mode (×àñòîòî-
çàâèñèìûé îòáîð).
Çàòåì ââåäèòå çíà÷åíèÿ ñëåäóþùèõ ïàðàìåòðîâ:
s – îïðåäåëÿåò èíòåíñèâíîñòü îòáîðà è õàðàêòåð åãî èçìåíåíèÿ âäîëü
ãðàäèåíòà (ñì. âûøå). Ìîæåò âàðüèðîâàòü îò 0 äî 1.
g – îïðåäåëÿåò èíòåíñèâíîñòü ìèãðàöèÿ îñîáåé ìåæäó äåìàìè (ñì.
âûøå). Ìîæåò âàðüèðîâàòü îò 0 äî 1.
h1 – ìèíèìàëüíîå ñåëåêòèâíîå ïðåèìóùåñòâî ãåòåðîçèãîò ïî ñðàâíå-
íèþ ãîìîçèãîòàìè. Ïàðàìåòð èñïîëüçóåòñÿ òîëüêî â ðåæèìå
“Ïðåèìóùåñòâî ãåòåðîçèãîò” (ñì. âûøå). Ìîæåò âàðüèðîâàòü îò 0 äî
1. Ïðè ýòîì, îäíàêî, âåëè÷èíà s íå ìîæåò áûòü áîëüøå, ÷åì (1–h1).
Åñëè âû èñïîëüçóåòå çíà÷åíèÿ, íå óäîâëåòâîðÿþùèå ýòîìó
óñëîâèþ, ïðîãðàììà àâòîìàòè÷åñêè ââåäåò êîððåêòèâû.
h2 – ïîñòîÿííîå ñåëåêòèâíîå ïðåèìóùåñòâî ãåòåðîçèãîò ïî ñðàâíå-
íèþ ñ íàèáîëåå ïðèñïîñîáëåííîé â äàííîì äåìå ãîìîçèãîòîé.
Ïàðàìåòð èñïîëüçóåòñÿ òîëüêî â ðåæèìå “Ëîêàëüíîå ïðåèìóùåñòâî
ãåòåðîçèãîò” (ñì. âûøå). Ìîæåò âàðüèðîâàòü îò 0 äî 1. Ïðè ýòîì,
îäíàêî, âåëè÷èíà s íå ìîæåò áûòü áîëüøå, ÷åì (1–h2). Åñëè âû
èñïîëüçóåòå çíà÷åíèÿ, íå óäîâëåòâîðÿþùèå ýòîìó óñëîâèþ,
ïðîãðàììà àâòîìàòè÷åñêè ââåäåò êîððåêòèâû.
How many generations would you want calculated between each view? –
Ñêîëüêî ïîêîëåíèé äîëæíî ïðîõîäèòü ìåæäó ïîñëåäîâàòåëüíûìè
êàðòèíêàìè? Ââåäèòå âåëè÷èíó èíòåðâàëà (â ïîêîëåíèÿõ), êîòîðûé
ïðîãðàììà áóäåò ïðîñ÷èòûâàòü ìåæäó î÷åðåäíûìè êàðòèíêàìè. Ïî
óìîë÷àíèþ – 10; ìèíèìàëüíàÿ âåëè÷èíà – 1, ìàêñèìàëüíàÿ – 10000
ïîêîëåíèé.
Ïîÿñíåíèÿ ê îêíó âûâîäà ðåçóëüòàòîâ ìîäåëèðîâàíèÿ
Ðåçóëüòàòû ðàáîòû ïðîãðàììû ïðåäñòàþò â âèäå ãðàôèêà , ïîêàçû-
âàþùåãî èçìåíåíèå ÷àñòîòû àëëåëè A âäîëü ãðàäèåíòà ñðåäû, èçîáðà-
æàåìîãî îñüþ àáñöèññ, ò.å. îò äåìà 1 ñëåâà äî äåìà 50 ñïðàâà. Ïåðâîíà-
÷àëüíàÿ ÷àñòîòà àëëåëè A âî âñåõ äåìàõ âñåãäà ñîñòàâëÿåò 0.5. Ïîýòîìó
ïîñëå ïåðâîãî íàæàòèÿ <Enter> âû óâèäèòå êàðòèíó ðàñïðåäåëåíèÿ ÷àñòîò
â ïîêîëåíèè 0. Ýòî ïðÿìàÿ ëèíèÿ, ïðîõîäÿùàÿ íà óðîâíå ÷àñòîòû p = 0.5
ïàðàëëåëüíî îñè àáñöèññ. Ïîñëå êàæäîãî ïîñëåäóþùåãî íàæàòèÿ <Enter>
âû áóäåòå âèäåòü ðåçóëüòàòû ìîäåëèðîâàíèÿ ïðîöåññà ÷åðåç 10, 20, 30
è ò.ä. ïîêîëåíèé (â çàâèñèìîñòè îò èíòåðâàëà, êîòîðûé âû óñòàíîâèëè
ñàìè – ñì. âûøå). Êàðòèíà ñíà÷àëà ìåíÿåòñÿ áûñòðî, à çàòåì ïðîöåññ
çàìåäëÿåòñÿ. Ïîýòîìó íàæìèòå êëàâèøó <Enter> è óäåðæèâàéòå äî òåõ
ïîð, ïîêà ïðîãðàììà íå âûäàñò ñîîáùåíèå î òîì, ÷òî ñèòóàöèÿ áëèçêà ê
ðàâíîâåñíîé: “The cline is near equilibrium. All 50 deme frequencies are
Страницы
- « первая
- ‹ предыдущая
- …
- 51
- 52
- 53
- 54
- 55
- …
- следующая ›
- последняя »
