Экология микроорганизмов экстремальных водных систем. Намсараев Б.Б - 71 стр.

UptoLike

Рубрика: 

71
лить последовательность вариабельного участка генома, кодирую-
щего ген 16S рРНК. Этого бывает достаточно, чтобы, сравнивая с
известными последовательностями из геномного банка, идентифи-
цировать микроорганизм до рода или даже вида.
Количественная оценка метаболизма микроорганизмов
Последние достижения в аналитической методологии позволяют
проводить измерение метаболической активности микроорганизмов
в их природных экологических нишах.
Определение гетеротрофного потенциала данной экониши ведут
при изучении включения радиоактивной метки (обычно
14
С из вве-
денных в образец меченых субстратов). Определение скоростей ак-
тивности микроорганизмов этим методом ограничено набором суб-
стратов, используемых данным сообществом. Обычно при опреде-
лении гетеротрофного потенциала местообитания используют аце-
тат, глюкозу и другие углеводы, глутамат и другие аминокислоты
или смесь меченых продуктов фотосинтеза, образуемых после ин-
кубации водорослей на свету с
14
СО
2
.
При оценке метаболической активности популяций определяют
также процент дыхания, подсчитываемый как отношение суммы
включенного
14
С и выделившегося
14
СО
2
к выделившемуся СО
2
,
выраженному в процентах.
Измерение скорости микробной продукции проводят обычно с
использованием меченного тритием тимидина {[
3
Н]-Тд}, который
включается непосредственно в ДНК при биосинтезе и отражает
скорость роста микроорганизмов в популяции или прироста био-
массы. Поскольку [
3
Н]-Тд включается лишь в бактериальную ДНК,
этот метод оказался чрезвычайно удобным для анализа скоростей
роста водных бактериальных популяций.
Скорость фотосинтеза измеряют обычно в водных образцах в
светлых и темных склянках с введенной порцией
14
СО
2
. Образцы
инкубируют в течение нескольких часов или всего светового пе-
риода in situ и определяют скорость включения меченой углекисло-
ты (обычно в течение первых 1-2 ч инкубации), что отражает ско-
рость фотосинтеза и общее включенное количество
14
СО
2
(за более
длительный период), что соответствует чистой продукции фотосин-
теза (т.е. разнице между количеством включенного
14
СО
2
и количе-
ством органического вещества, минерализованного до
14
СО
2
в ре-
лить последовательность вариабельного участка генома, кодирую-
щего ген 16S рРНК. Этого бывает достаточно, чтобы, сравнивая с
известными последовательностями из геномного банка, идентифи-
цировать микроорганизм до рода или даже вида.

   Количественная оценка метаболизма микроорганизмов
   Последние достижения в аналитической методологии позволяют
проводить измерение метаболической активности микроорганизмов
в их природных экологических нишах.
   Определение гетеротрофного потенциала данной экониши ведут
при изучении включения радиоактивной метки (обычно 14С из вве-
денных в образец меченых субстратов). Определение скоростей ак-
тивности микроорганизмов этим методом ограничено набором суб-
стратов, используемых данным сообществом. Обычно при опреде-
лении гетеротрофного потенциала местообитания используют аце-
тат, глюкозу и другие углеводы, глутамат и другие аминокислоты
или смесь меченых продуктов фотосинтеза, образуемых после ин-
кубации водорослей на свету с 14СО2.
    При оценке метаболической активности популяций определяют
также процент дыхания, подсчитываемый как отношение суммы
включенного 14С и выделившегося 14СО2 к выделившемуся СО2,
выраженному в процентах.
   Измерение скорости микробной продукции проводят обычно с
использованием меченного тритием тимидина {[3Н]-Тд}, который
включается непосредственно в ДНК при биосинтезе и отражает
скорость роста микроорганизмов в популяции или прироста био-
массы. Поскольку [3Н]-Тд включается лишь в бактериальную ДНК,
этот метод оказался чрезвычайно удобным для анализа скоростей
роста водных бактериальных популяций.
   Скорость фотосинтеза измеряют обычно в водных образцах в
светлых и темных склянках с введенной порцией 14СО2. Образцы
инкубируют в течение нескольких часов или всего светового пе-
риода in situ и определяют скорость включения меченой углекисло-
ты (обычно в течение первых 1-2 ч инкубации), что отражает ско-
рость фотосинтеза и общее включенное количество 14СО2 (за более
длительный период), что соответствует чистой продукции фотосин-
теза (т.е. разнице между количеством включенного 14СО2 и количе-
ством органического вещества, минерализованного до 14СО2 в ре-
                              71