Экология микроорганизмов экстремальных водных систем. Намсараев Б.Б - 72 стр.

UptoLike

Рубрика: 

72
зультате дыхания).
Скорость дыхания определяют по измерению скорости выделе-
ния
14
СО
2
из органических субстратов, что отражает скорость мине-
рализации органического вещества данной экологической ниши.
Существуют также методы нерадиоактивного определения мета-
болической активности, при которых измеряют скорость дыхания
пробы, взятой из данного места, с помощью закрытого кисло-
родного электрода Кларка, или способы измерения образования
СО
2
в постоянно аэрируемой пробе, куда внесен субстрат дыхания.
Определение активности специфических ферментов также от-
ражает метаболический потенциал микробной популяции данной
экологической ниши. Активность одних ферментов (суммарных
дегидрогеназ, эстераз, фосфатаз) отражает энзиматический по-
тенциал всего сообщества, активность других (целлюлазная, хити-
назная, нитрогеназная, денитрифицирующая) – только спе-
цифической части сообщества.
При измерении ферментативных активностей in situ важно не
нарушать микроокружение данной ниши и следить за температу-
рой, рН, влажностью, Eh (ОВП), а периоды инкубации (измерений)
должны быть достаточно короткими, чтобы за это время число мик-
роорганизмов не могло значительно измениться.
Отбор проб для молекулярно-биологических исследований
При изучении разнообразия микроорганизмов и их видового со-
става используют молекулярно-биологические методы исследова-
ния. К ним относятся выделение ДНК, проведение ПЦР, клониро-
вание генов, FISH-метод, получение ДНК зондов, изучение струк-
туры микробных ДНК и РНК, состава белков и липидов.
Для проведения молекулярно-биологических исследований воду
фильтруют через газовую сетку, фильтры диаметром пор 0,4 мк и
0,2 мк для раздельной концентрации водорослей, цианобактерий,
эубактерий и архебактерий. Фильтры с пробами высушить. Донные
осадки и микробные маты до лаборатории хранить при температуре
ниже 5 °С в стеклянной посуде или полиэтиленовом пакете. Почву
просеивают через сито с диаметром ячеек 3 мм, освобождают от
корней и растительных остатков. Хранение при 4-6 °С в полиэтиле-
новом пакете.
зультате дыхания).
   Скорость дыхания определяют по измерению скорости выделе-
ния 14СО2 из органических субстратов, что отражает скорость мине-
рализации органического вещества данной экологической ниши.
Существуют также методы нерадиоактивного определения мета-
болической активности, при которых измеряют скорость дыхания
пробы, взятой из данного места, с помощью закрытого кисло-
родного электрода Кларка, или способы измерения образования
СО2 в постоянно аэрируемой пробе, куда внесен субстрат дыхания.
   Определение активности специфических ферментов также от-
ражает метаболический потенциал микробной популяции данной
экологической ниши. Активность одних ферментов (суммарных
дегидрогеназ, эстераз, фосфатаз) отражает энзиматический по-
тенциал всего сообщества, активность других (целлюлазная, хити-
назная, нитрогеназная, денитрифицирующая) – только спе-
цифической части сообщества.
   При измерении ферментативных активностей in situ важно не
нарушать микроокружение данной ниши и следить за температу-
рой, рН, влажностью, Eh (ОВП), а периоды инкубации (измерений)
должны быть достаточно короткими, чтобы за это время число мик-
роорганизмов не могло значительно измениться.

   Отбор проб для молекулярно-биологических исследований
   При изучении разнообразия микроорганизмов и их видового со-
става используют молекулярно-биологические методы исследова-
ния. К ним относятся выделение ДНК, проведение ПЦР, клониро-
вание генов, FISH-метод, получение ДНК зондов, изучение струк-
туры микробных ДНК и РНК, состава белков и липидов.
   Для проведения молекулярно-биологических исследований воду
фильтруют через газовую сетку, фильтры диаметром пор 0,4 мк и
0,2 мк для раздельной концентрации водорослей, цианобактерий,
эубактерий и архебактерий. Фильтры с пробами высушить. Донные
осадки и микробные маты до лаборатории хранить при температуре
ниже 5 °С в стеклянной посуде или полиэтиленовом пакете. Почву
просеивают через сито с диаметром ячеек 3 мм, освобождают от
корней и растительных остатков. Хранение при 4-6 °С в полиэтиле-
новом пакете.

                               72