Практикум по математическому моделированию в теории эволюции. Часть 1. Факторы микроэволюции. Кипятков В.Е. - 59 стр.

UptoLike

Составители: 

Рубрика: 

58
fixed or lost the segregating polymorphism” – “Âî âñåõ øåñòè äåìàõ ïðîèçî-
øëà ôèêñàöèÿ èëè óòðàòà”.
Âòîðàÿ äèàãðàììà ïîêàçûâàåò äèíàìèêó òðåõ êîýôôèöèåíòîâ èíáðè-
äèíãà – Fis, Fst è Fit, îò ïîêîëåíèÿ ê ïîêîëåíèþ. ×åì ìåíüøå ïîòîê ãåíîâ,
ò.å. ÷åì âûøå ñòåïåíü ïîäðàçäåëåííîñòè ïîïóëÿöèè, òåì áîëüøèå
ðàçëè÷èÿ ìåæäó äåìàìè ìîãóò âîçíèêàòü âñëåäñòâèå äðåéôà, ÷òî íàõîäèò
îòðàæåíèå â çíà÷èòåëüíîì âîçðàñòàíèè Fst è Fit ïðè îòñóòñòâèè èëè î÷åíü
ìàëîé (< 0.02) èíòåíñèâíîñòè ìèãðàöèé. Ïðè íåñêîëüêî áîëåå âûñîêèõ
óðîâíÿõ ïîòîêà ãåíîâ (ïðèìåðíî îò 0.02 äî 0.05) âñå åùå âîçìîæíî
âîçíèêíîâåíèå çàìåòíîé äèôôåðåíöèàöèè ìåæäó äåìàìè è êîýôôè-
öèåíòû Fst è Fit òàêæå âîçðàñòàþò.  ñèòóàöèè çíà÷èòåëüíîé ïîäðàçäåëåí-
íîñòè ïîïóëÿöèè ïðîíèêíîâåíèå ìèãðàíòîâ, íåñóùèõ àëüòåðíàòèâíûå
àëëåëè, ìîæåò âûçûâàòü âðåìåííûé èçáûòîê ãåòåðîçèãîò â îòäåëüíûõ
äåìàõ, ÷òî íàõîäèò îòðàæåíèå â îòðèöàòåëüíûõ çíà÷åíèÿõ êîýôôèöèåíòà
Fisòàê íàçûâàåìûéýôôåêò Âàëóíäà”. Êîãäà óðîâåíü ïîòîêà ãåíîâ
äîñòàòî÷íî âûñîê, çíà÷èòåëüíàÿ äèôôåðåíöèàöèÿ ìåæäó äåìàìè ñòàíî-
âèòñÿ íåâîçìîæíîé, ò.å. ïîïóëÿöèÿ â öåëîì ñòàíîâèòñÿ ãåíåòè÷åñêè áîëåå
ãîìîãåííîé.  âåðõíåé ÷àñòè ýêðàíà ïðîãðàììà âûâîäèò èñõîäíûå
çíà÷åíèÿ: âåëè÷èíû äåìà (Deme Size) è ÷àñòîòû ìèãðàöèé (Migration
Rate).
Èññëåäîâàíèå ìîäåëè
Êàæäûé öèêë ìîäåëèðîâàíèÿ ñ îäíèìè è òåìè æå ïàðàìåòðàìè äàåò
èíûå ðåçóëüòàòû âñëåäñòâèå ñòîõàñòè÷íîñòè ïðîöåññà. Ñëåäîâàòåëüíî,
èññëåäóÿ êàæäóþ ñèòóàöèþ, âû äîëæíû çàïóñêàòü ïðîãðàììó ìíîãîêðàòíî
(íå ìåíåå 5 ðàç), êàæäûé ðàç çàïèñûâàÿ ïîëó÷åííûé ðåçóëüòàò, à çàòåì
óæå äåëàòü âûâîäû àíàëèçèðóÿ âñå ïðîâåäåííûå èñïûòàíèÿ.
1. Ðåêîìåíäóåì íà÷àòü ðàáîòó ñ ïàðàìåòðàìè, óñòàíîâëåííûìè ïî
óìîë÷àíèþ. Îíè ìîäåëèðóþò ïîïóëÿöèþ, ïîäðàçäåëåííóþ íà äåìû î÷åíü
íåáîëüøîé âåëè÷èíû (12 îñîáåé), ïðè î÷åíü íåâûñîêîì (0.01) óðîâíå
ïîòîêà ãåíîâ ìåæäó íèìè. Çàòåì èñïîëüçóéòå èíûå çíà÷åíèÿ âåëè÷èíû
äåìîâ (âî âñåì âîçìîæíîì èíòåðâàëå îò 1 äî 500), èíòåíñèâíîñòè
ìèãðàöèé (íàïðèìåð, 0, 0.001, 0.01, 0.02, 0.03, 0.05, 0.1, 0.5, 0.8, 1.0) è
íà÷àëüíîé àëëåëüíîé ÷àñòîòû p. Îáÿçàòåëüíî îáðàòèòå âíèìàíèå íà òî,
êàê ïîÿâëÿþòñÿ óòðà÷åííûå àëëåëè âñëåäñòâèå ìèãðàöèé îñîáåé èç
äðóãèõ äåìîâ.
2.  ðåçóëüòàòå ðàáîòû âû äîëæíû óñòàíîâèòü, êàê çàâèñÿò îò âåëè÷è-
íû äåìîâ, èíòåíñèâíîñòè ìèãðàöèé è íà÷àëüíûõ àëëåëüíûõ ÷àñòîò:
(1) ñòåïåíü âîçìîæíîé ãåíåòè÷åñêîé äèôôåðåíöèàöèè ìåæäó äåìàìè,
(2) âðåìÿ, íåîáõîäèìîå äëÿ ôèêñàöèè èëè ïîòåðè àëëåëè A âî âñåõ øåñòè
äåìàõ, (3) õàðàêòåð äèíàìèêè êîýôôèöèåíòîâ èíáðèäèíãà Fis, Fst è Fit.