Составители:
Рубрика:
56
Êîýôôèöèåíò Fst îöåíèâàåò íåõâàòêó ãåòåðîçèãîò, âîçíèêàþùóþ â
ðåçóëüòàòå ïîäðàçäåëåííîñòè ïîïóëÿöèè è ñëó÷àéíîãî äðåéôà àëëåëü-
íûõ ÷àñòîò â êàæäîì äåìå:
Fst = (Ht – Hs)/Ht (34)
Êîýôôèöèåíò Fit îöåíèâàåò îáùóþ íåõâàòêó ãåòåðîçèãîò âî âñåé
ïîïóëÿöèè, âîçíèêàþùóþ âñëåäñòâèå îáåèõ ïðè÷èí; ôàêòè÷åñêè ýòî
ñóììàðíûé êîýôôèöèåíò èíáðèäèíãà, âû÷èñëÿåìûé êàê:
Fit = (Ht – Hi)/Ht (35)
Íàøà ïðîãðàììà ìîäåëèðóåò íåáîëüøóþ ïîïóëÿöèþ, ïîäðàçäåëåííóþ
íà 6 äåìîâ ïîñòîÿííîé è îäèíàêîâîé âåëè÷èíû, êîòîðóþ ìîæíî èçìåíÿòü,
çàäàâàÿ òàêèì îáðàçîì èíòåíñèâíîñòü äðåéôà. Ìîäåëèðîâàíèå ïðîöåññîâ
äðåéôà îñíîâàíî íà ìåòîäå Ìîíòå Êàðëî. Â êàæäîì äåìå ïðîãðàììà
ôîðìèðóåò ñëó÷àéíóþ âûáîðêó ãàìåò, êîòîðûå äàþò íîâîå ïîêîëåíèå
îñîáåé. Êðîìå òîãî, â êàæäîì ïîêîëåíèè ÷àñòü îñîáåé â äåìå çàìåùàþò
“ìèãðàíòû”, ãåíîòèïè÷åñêèå ÷àñòîòû êîòîðûõ ñîîòâåòñòâóþò ñðåäíèì
àëëåëüíûì ÷àñòîòàì âî âñåé ïîïóëÿöèè. Èíòåíñèâíîñòü ïîòîêà ãåíîâ
ìåæäó äåìàìè, çàäàåòñÿ ïàðàìåòðîì “÷àñòîòà ìèãðàöèé”, ò.å. äîëåé
çàìåùàåìûõ â êàæäîì ïîêîëåíèè îñîáåé, êîòîðàÿ ìîæåò âàðüèðîâàòü îò
0 äî 1. Ïðè ìîäåëèðîâàíèè ìèãðàöèé ïðîãðàììà äëÿ êàæäîé îñîáè â
êàæäîì äåìå ãåíåðèðóåò ñëó÷àéíîå ÷èñëî â èíòåðâàëå îò 0 äî 1. Åñëè îíî
îêàçûâàåòñÿ áîëüøå ÷àñòîòû ìèãðàöèé, òî îñîáü îñòàåòñÿ íà ìåñòå, à
åñëè áîëüøå – îñîáü çàìåùàåòñÿ “ìèãðàíòîì”, âûáðàííûì â ñëó÷àéíîì
ïîðÿäêå èç îáùåãî “ïóëà ìèãðàíòîâ”, àëëåëüíûå ÷àñòîòû â êîòîðîì
ñîîòâåòñòâóþò ñðåäíèì äëÿ ïîïóëÿöèè â öåëîì.
 çàâèñèìîñòè îò âåëè÷èíû äåìîâ è èíòåíñèâíîñòè ïîòîêà ãåíîâ ìåæäó
íèìè ìîãóò áûòü ïîëó÷åíû âåñüìà ðàçëè÷íûå ðåçóëüòàòû. Èñõîäíûå
àëëåëüíûå ÷àñòîòû â 6 äåìàõ ìîãóò áûòü îäèíàêîâû, èëè ðàçëè÷íû, ÷òî
ìîæíî èñïîëüçîâàòü äëÿ äåìîíñòðàöèè ýôôåêòà îñíîâàòåëÿ.
Äàííàÿ ïðîãðàììà èñïîëüçóåò äëÿ âû÷èñëåíèé óðàâíåíèÿ, ïðèâåäåí-
íûå âûøå. Îäíàêî, ñëåäóåò èìåòü â âèäó, ÷òî â èññëåäîâàíèÿõ íà ðåàëü-
íûõ ïîïóëÿöèÿõ ïðèìåíÿþò çíà÷èòåëüíî áîëåå ñëîæíûé ìàòåìàòè÷åñêèé
àïïàðàò, ó÷èòûâàþùèé îøèáêó âûáîðêè è äèñïåðñèþ àëëåëüíûõ ÷àñòîò.
Äëÿ îçíàêîìëåíèÿ ñ ýòèì âîïðîñîì ñëåäóåò îáðàòèòüñÿ ê ñïåöèàëüíîé
ëèòåðàòóðå.
Ïðàêòè÷åñêàÿ ðàáîòà ñ ìîäåëüþ
Ïîÿñíåíèÿ ê îêíó ââîäà ïàðàìåòðîâ ìîäåëè
Please enter a size and a migration rate common to all six demes –
Ïîæàëóéñòà, ââåäèòå çíà÷åíèÿ ÷èñëåííîñòè è ÷àñòîòû ìèãðà-
öèé, îäèíàêîâûå äëÿ âñåõ øåñòè äåìîâ:
Страницы
- « первая
- ‹ предыдущая
- …
- 55
- 56
- 57
- 58
- 59
- …
- следующая ›
- последняя »
