Применение неэмпирических и полуэмпирических методов в квантово-химических расчетах. Кобзев Г.И. - 46 стр.

      Рисунок 1 – Диалоговое окно молекулярной механики MM+ Options
    Диалоговое окно ММ+ содержит набор настроек для соответствующего
силового поля.
    Electrostatics (Электростатика) Нековалентные электростатические
взаимодействия рассчитываются с использованием взаимодействий
дипольного типа или частичных атомных зарядов.
    Bond      dipoles   используется    для     расчетов      нековалентных
электростатических взаимодействий. Значение этого параметра определяется
в файле параметров MM+.
    Atomic      charges  используется    для    расчетов      нековалентных
электростатических взаимодействий. Вы можете задавать неполные
(частичные) атомные заряды посредством меню Build, пункта Set Charge или
вы можете проводить полуэмпирические или ab initio расчеты, сначала
рассчитывая частичные заряды для каждого атома методом Малликена.
    Cutoffs (Отключение). Данный параметр определяет минимальное
расстояние для нековалентных взаимодействий.
   Switched вводит сглаживающую функцию при расчетах молекул в Periodic
Box (Периодический ящик). Этот подход позволяет плавно уменьшать
слабые взаимодействия вплоть до нуля, перемещаясь из внутренней сферы во
внешнюю. В этом случае Hyper Chem устанавливает параметр Switched и
значения внутренней (Inner) и внешней (Outer) сфер (Spheres).
   None. Этот параметр устанавливается для расчета систем в вакууме.
   Shifted вводит сглаживающую функцию, которая действует на все
пространство от 0 до внешней сферы. Эта функция позволяет плавно
уменьшать нековалентные взаимодействия до 0.
   Outer radius для параметров Switched и Shifted определяет минимальное
расстояние, на котором нековалентные взаимодействия становятся равными
0. Обыкновенно это значение выбирается не менее чем на 4 ангстрема
больше, чем внутренний радиус. Для периодических граничных условий это
значение равно половине минимального размера периодического ящика.
   Inner radius выбирается только в случае установки Switched cutoffs. Это
максимальное межатомное расстояние для полного учета нековалентных
взаимодействий. В случае выбора периодических граничных условий это
значение выбирается на 4 ангстрема меньше, чем половина минимального
размера Периодического ящика, или менее, вплоть до 0. Внимание,

                                                                         46