Применение неэмпирических и полуэмпирических методов в квантово-химических расчетах. Кобзев Г.И. - 44 стр.

UptoLike

Составители: 

Рубрика: 

44
3 Расчеты в HYPERCHEM
Введение
Пакет программ HyperChem позволяет проводить неэмпирические и
полуэмпирические расчеты электронных, спектральных и магнитных
характеристик молекул и межмолекулярных комплексов, а также вычислять
энергию переходных состояний комплексов, характеристики гидратной или
сольватной оболочки, производить простейшие расчеты характеристик
кристаллов, расчеты электронных и колебательных спектров.
Последняя версия 7.0 содержит, как и предыдущие версии, графический
редактор, большую базу данных по строению нуклеотидов, полимеров,
элементарных ячеек и способна считать методом функционала плотности
(DFT) с использованием разных обменно-корреляционных потенциалов.
Достаточно большой набор различных методов молекулярной механики,
полуэмпирических методов и всевозможные типы базисов, используемые в
ab initio расчетах, включая расщепленные и поляризованные, обеспечивают
широкий спектр вычислений. Программа написана под Windows, но, к
сожалению, ab initio расчеты даже в базисе 3-21G требуют больших ресурсов
оперативной и общей памяти машины, большой мощности процессора. К
тому же, по окончанию расчетов электронного спектра с многократным КВ
на выходе не указана структура возбужденных состояний и провести
отнесение подобно расчетам с однократным КВ не представляется
возможным. Несомненным преимуществом программы
HYPERCHEM
является возможность наглядного изображения графической структуры
молекулы и изменение геометрических параметров при оптимизации
химической системы, а также визуализация полученных в результате
расчетов молекулярных орбиталей, относительной интенсивности
электронных 0-0 переходов, потенциалов в двумерном и трехмерном
изображении и анимация колебательных мод. Большая база данных
позволяет построить белки, полимеры, фрагменты ДНК, кластеры металлов,
современные системы металлоорганических соединений.
3.1 Методы расчета используемые в пакете HyperChem
3.1.1. Методы молекулярной механики (ММ+, AMBER, BIO+,
OPLS)
Выбор в меню пункта Setup, и метода молекулярной механики,
позволяет использовать классический Ньютоновский метод вычислений
энергии одной точки, равновесной геометрии и молекулярной динамики
объектов вместо квантовомеханического подхода (одного из
полуэмпирических методов или неэмпирического метода Хартри-Фока (ab
initio)). В методе молекулярной механики атомы рассматриваются как
     3 Расчеты в HYPERCHEM

                                  Введение

   Пакет программ HyperChem позволяет проводить неэмпирические и
полуэмпирические расчеты электронных, спектральных и магнитных
характеристик молекул и межмолекулярных комплексов, а также вычислять
энергию переходных состояний комплексов, характеристики гидратной или
сольватной оболочки, производить простейшие расчеты характеристик
кристаллов, расчеты электронных и колебательных спектров.
   Последняя версия 7.0 содержит, как и предыдущие версии, графический
редактор, большую базу данных по строению нуклеотидов, полимеров,
элементарных ячеек и способна считать методом функционала плотности
(DFT) с использованием разных обменно-корреляционных потенциалов.
Достаточно большой набор различных методов молекулярной механики,
полуэмпирических методов и всевозможные типы базисов, используемые в
ab initio расчетах, включая расщепленные и поляризованные, обеспечивают
широкий спектр вычислений. Программа написана под Windows, но, к
сожалению, ab initio расчеты даже в базисе 3-21G требуют больших ресурсов
оперативной и общей памяти машины, большой мощности процессора. К
тому же, по окончанию расчетов электронного спектра с многократным КВ
на выходе не указана структура возбужденных состояний и провести
отнесение подобно расчетам с однократным КВ не представляется
возможным.       Несомненным преимуществом программы HYPERCHEM
является возможность наглядного изображения графической структуры
молекулы и изменение геометрических параметров при оптимизации
химической системы, а также визуализация полученных в результате
расчетов     молекулярных     орбиталей,    относительной   интенсивности
электронных 0-0 переходов, потенциалов в двумерном и трехмерном
изображении и анимация колебательных мод.           Большая база данных
позволяет построить белки, полимеры, фрагменты ДНК, кластеры металлов,
современные системы металлоорганических соединений.

     3.1 Методы расчета используемые в пакете HyperChem

    3.1.1. Методы молекулярной        механики (ММ+, AMBER, BIO+,
OPLS)

       Выбор в меню пункта Setup, и метода молекулярной механики,
позволяет использовать классический Ньютоновский метод вычислений
энергии одной точки, равновесной геометрии и молекулярной динамики
объектов     вместо   квантовомеханического  подхода   (одного   из
полуэмпирических методов или неэмпирического метода Хартри-Фока (ab
initio)). В методе молекулярной механики атомы рассматриваются как

                                                                       44