ВУЗ:
Составители:
Рубрика:
44
3 Расчеты в HYPERCHEM
Введение
Пакет программ HyperChem позволяет проводить неэмпирические и
полуэмпирические расчеты электронных, спектральных и магнитных
характеристик молекул и межмолекулярных комплексов, а также вычислять
энергию переходных состояний комплексов, характеристики гидратной или
сольватной оболочки, производить простейшие расчеты характеристик
кристаллов, расчеты электронных и колебательных спектров.
Последняя версия 7.0 содержит, как и предыдущие версии, графический
редактор, большую базу данных по строению нуклеотидов, полимеров,
элементарных ячеек и способна считать методом функционала плотности
(DFT) с использованием разных обменно-корреляционных потенциалов.
Достаточно большой набор различных методов молекулярной механики,
полуэмпирических методов и всевозможные типы базисов, используемые в
ab initio расчетах, включая расщепленные и поляризованные, обеспечивают
широкий спектр вычислений. Программа написана под Windows, но, к
сожалению, ab initio расчеты даже в базисе 3-21G требуют больших ресурсов
оперативной и общей памяти машины, большой мощности процессора. К
тому же, по окончанию расчетов электронного спектра с многократным КВ
на выходе не указана структура возбужденных состояний и провести
отнесение подобно расчетам с однократным КВ не представляется
возможным. Несомненным преимуществом программы
HYPERCHEM
является возможность наглядного изображения графической структуры
молекулы и изменение геометрических параметров при оптимизации
химической системы, а также визуализация полученных в результате
расчетов молекулярных орбиталей, относительной интенсивности
электронных 0-0 переходов, потенциалов в двумерном и трехмерном
изображении и анимация колебательных мод. Большая база данных
позволяет построить белки, полимеры, фрагменты ДНК, кластеры металлов,
современные системы металлоорганических соединений.
3.1 Методы расчета используемые в пакете HyperChem
3.1.1. Методы молекулярной механики (ММ+, AMBER, BIO+,
OPLS)
Выбор в меню пункта Setup, и метода молекулярной механики,
позволяет использовать классический Ньютоновский метод вычислений
энергии одной точки, равновесной геометрии и молекулярной динамики
объектов вместо квантовомеханического подхода (одного из
полуэмпирических методов или неэмпирического метода Хартри-Фока (ab
initio)). В методе молекулярной механики атомы рассматриваются как
3 Расчеты в HYPERCHEM Введение Пакет программ HyperChem позволяет проводить неэмпирические и полуэмпирические расчеты электронных, спектральных и магнитных характеристик молекул и межмолекулярных комплексов, а также вычислять энергию переходных состояний комплексов, характеристики гидратной или сольватной оболочки, производить простейшие расчеты характеристик кристаллов, расчеты электронных и колебательных спектров. Последняя версия 7.0 содержит, как и предыдущие версии, графический редактор, большую базу данных по строению нуклеотидов, полимеров, элементарных ячеек и способна считать методом функционала плотности (DFT) с использованием разных обменно-корреляционных потенциалов. Достаточно большой набор различных методов молекулярной механики, полуэмпирических методов и всевозможные типы базисов, используемые в ab initio расчетах, включая расщепленные и поляризованные, обеспечивают широкий спектр вычислений. Программа написана под Windows, но, к сожалению, ab initio расчеты даже в базисе 3-21G требуют больших ресурсов оперативной и общей памяти машины, большой мощности процессора. К тому же, по окончанию расчетов электронного спектра с многократным КВ на выходе не указана структура возбужденных состояний и провести отнесение подобно расчетам с однократным КВ не представляется возможным. Несомненным преимуществом программы HYPERCHEM является возможность наглядного изображения графической структуры молекулы и изменение геометрических параметров при оптимизации химической системы, а также визуализация полученных в результате расчетов молекулярных орбиталей, относительной интенсивности электронных 0-0 переходов, потенциалов в двумерном и трехмерном изображении и анимация колебательных мод. Большая база данных позволяет построить белки, полимеры, фрагменты ДНК, кластеры металлов, современные системы металлоорганических соединений. 3.1 Методы расчета используемые в пакете HyperChem 3.1.1. Методы молекулярной механики (ММ+, AMBER, BIO+, OPLS) Выбор в меню пункта Setup, и метода молекулярной механики, позволяет использовать классический Ньютоновский метод вычислений энергии одной точки, равновесной геометрии и молекулярной динамики объектов вместо квантовомеханического подхода (одного из полуэмпирических методов или неэмпирического метода Хартри-Фока (ab initio)). В методе молекулярной механики атомы рассматриваются как 44
Страницы
- « первая
- ‹ предыдущая
- …
- 42
- 43
- 44
- 45
- 46
- …
- следующая ›
- последняя »