Применение неэмпирических и полуэмпирических методов в квантово-химических расчетах. Кобзев Г.И. - 47 стр.

UptoLike

ВУЗ: 

ОГУ | Оренбург

Составители: 

Рубрика: 

47
установки Cutoffs возвращаются к своим стандартным значениям в случае,
когда в рабочее поле помещается новая молекула.
3.1.1.1 Диалоговое окно опций силового поля (Force Field Options
Dialog Box)
Это окно используется для выбора параметров силовых полей AMBER,
BIO+ и OPLS. HyperChem хранит значения этих параметров, исключая
параметры Cutoffs, в Registry или в файле chem..ini и использует их для
последующих вычислений.
Рисунок 2 – Задание параметров силового поля
Dielectric permittivity (epsilon) (диэликтрическая постоянная). Параметры
Constant (Постоянная) или Distance dependent (Зависящая от расстояния)
определяют методы расчета диэлектрической постоянной эпсилон, фактора,
который модифицирует взаимодействие зарядов (и электростатического
потенциала).
Constant - Постоянная. Выбор этого параметра оставляет диэлектрическую
постоянную константой и соответствует периодическим граничным
условиям Периодического ящика. Выбор этого пункта соответствует
веществу, находящемуся в газовой фазе, либо в идеальном растворе.
Distance dependent - Зависящая от расстояния. Выбор этого параметра
делает эпсилон пропорциональной межатомному расстоянию. Подобный
подход аппроксимирует эффект сольватации в отсутствии идеального
растворителя и позволяет убыстрять расчеты. Данный параметр
рекомендуется использовать при расчетах методом OPLS. Так как данный
параметр моделирует присутствие сольвента, его не следует применять,
когда молекулы сольвента присутствуют в моделируемой системе.
В случае выбора параметра Constant вы можете изменить константу
эпсилон (epsilon), определяющую диэлектрическую постоянную среды
окружающего свободного пространства. (масштабный множитель (Scale
factor). По умолчанию он принимается равным 1, что удовлетворяет
большинству рассчитываемых систем.
В случае выбора опции Distance dependent необходимо указать
дополнительные два параметра для электростатических и ван-дер-ваальсовых 
установки Cutoffs возвращаются к своим стандартным значениям в случае,
когда в рабочее поле помещается новая молекула.

      3.1.1.1 Диалоговое окно опций силового поля (Force Field Options
Dialog Box)

   Это окно используется для выбора параметров силовых полей AMBER,
BIO+ и OPLS. HyperChem хранит значения этих параметров, исключая
параметры Cutoffs, в Registry или в файле chem..ini и использует их для
последующих вычислений.




     Рисунок 2 – Задание параметров силового поля

    Dielectric permittivity (epsilon) (диэликтрическая постоянная). Параметры
Constant (Постоянная) или Distance dependent (Зависящая от расстояния)
определяют методы расчета диэлектрической постоянной эпсилон, фактора,
который модифицирует взаимодействие зарядов (и электростатического
потенциала).
   Constant - Постоянная. Выбор этого параметра оставляет диэлектрическую
постоянную константой и соответствует периодическим граничным
условиям Периодического ящика. Выбор этого пункта соответствует
веществу, находящемуся в газовой фазе, либо в идеальном растворе.
   Distance dependent - Зависящая от расстояния. Выбор этого параметра
делает эпсилон пропорциональной межатомному расстоянию. Подобный
подход аппроксимирует эффект сольватации в отсутствии идеального
растворителя и позволяет убыстрять расчеты. Данный параметр
рекомендуется использовать при расчетах методом OPLS. Так как данный
параметр моделирует присутствие сольвента, его не следует применять,
когда молекулы сольвента присутствуют в моделируемой системе.
   В случае выбора параметра Constant вы можете изменить константу
эпсилон (epsilon), определяющую диэлектрическую постоянную среды
окружающего свободного пространства. (масштабный множитель (Scale
factor). По умолчанию он принимается равным 1, что удовлетворяет
большинству рассчитываемых систем.
   В случае выбора опции Distance dependent необходимо указать
дополнительные два параметра для электростатических и ван-дер-ваальсовых
                                                                           47

Страницы