Применение неэмпирических и полуэмпирических методов в квантово-химических расчетах. Кобзев Г.И. - 60 стр.

кнопку появляется всплывающая подсказка, указывающая, назначение
выбранной кнопки. При двойном нажатии на первую кнопку draw появляется
таблица Менделеева, позволяющая выбрать тип атома, которым
производится рисование. С помощью второй кнопки select выделяют нужный
атом или фрагмент молекулы, и при необходимости, переносят его в другое
место окна путем удержания правой кнопки мышки. Кнопка (А) позволяет
нанести желаемый символ или текст в нужном месте картинки.
   Однако если мы хотим построить полипептидную цепь, состоящую из
стандартных аминокислотных остатков, нам не придётся ничего рисовать. В
этом случае аходим в databases > amino acids и выбираем соответствующее
соединение. При последовательном выборе нескольких аминокислот
программа сама соединит их в полипептидную цепь, при этом можно указать
альфа, бета или другую конформацию с указанием параметрови тип изомера.




     Рисунок 8 – Аминокислоты

   Если нажать последовательно ace trp nme, мы получим монопептид
ацетил-триптофанил-метиламин. Монопептидом он называется потому, что
содержит только одну аминокислоту, а ace и nme – это так называемые
заглушки, призванные олицетворять собой тот факт, что наша аминокислота
не свободна, а находится в полипептидной цепочке.
   Если мы хотим построить цепь ДНК или РНК, состоящую из стандартных
нуклеотидных остатков, нам не придётся ничего рисовать. Заходим в
databases > Nucleic acids.




     Рисунок 9 – Нуклеиновые кислоты



                                                                     60