Применение неэмпирических и полуэмпирических методов в квантово-химических расчетах. Кобзев Г.И. - 62 стр.

   В HyperChem существует возможность поместить молекулу в водную
среду. Для этого необходимо воспользоваться командой setup > periodic box.




     Рисунок 10 - Задание периодических условий.

   После открытия данного диалогового окна задают размеры периодических
параметров ящика, который с нажатием кнопки «ок» автоматически
заполняется молекулами воды.




     Рисунок 11 – Система, окруженная молекулами воды

   Указав параметры коробки необходимо отрелаксировать систему, перед
тем как сохранить файл, ибо не отрелаксированные химические системы при
расчёте некорректно разлетаются. Для этого в setup > molecular необходимо
выбрать метод расчета и с помощью опций «Option» и «Components»
выставить следующие установки:




                                                                        62