Применение неэмпирических и полуэмпирических методов в квантово-химических расчетах. Кобзев Г.И. - 63 стр.

     Рисунок 12 - Параметры для молекулярной динамики

   Затем входим в compute > geometry optimization, и выставляем следующие
параметры:




     Рисунок 13 – Параметры для релаксации

   Градиент можно выставить в разумных пределах (например, 0.01).
Нажимаем кнопку «Ок». Начиная с этого момента, Сyperchem начнет
усиленно считать, пока не достигнет градиента меньше, чем указано, или
пока не будет нажата кнопка «cancel».
   После окончания расчетов можно сохранить результаты нашего труда.
Hyperchem может сохранять в различных форматах, из которых нам
понадобятся только два: формат – hin и так называемый protein data bank с
расширением ent. Hin обладает тем преимуществом, что в нём сохраняется
вся информация, которой располагает НyperСhem, в частности
периодические условия, зато ent удобно редактировать текстовым

                                                                       63