Составители:
Рубрика:
12
cuaaguccaa cuacuaaacu gggggauauu augaagggcc uugagcaucu ggauucugcc
uaauaaaaaa cauuuauuuu cauugc
− сДНК:
acatttgctt ctgacacaac tgtgttcact agcaacctca aacagacacc atggtgcacc tgactcctga
ggagaagtct gcggttactg ccctgtgggg caaggtgaac gtggatgaag ttggtggtga
ggccctgggc aggctgctgg tggtctaccc ttggacccag aggttctttg agtcctttgg ggatctgtcc
actcctgatg cagttatggg caaccctaag gtgaaggctc atggcaagaa agtgctcggt gcctttagtg
atggcctggc tcacctggac aacctcaagg gcacctttgc cacactgagt gagctgcact gtgacaagct
gcacgtggat cctgagaact tcaggctcct gggcaacgtg ctggtctgtg tgctggccca tcactttggc
aaagaattca ccccaccagt gcaggctgcc tatcagaaag tggtggctgg tgtggctaat gccctggccc
acaagtatca ctaagctcgc tttcttgctg tccaatttct attaaaggtt cctttgttcc ctaagtccaa
ctactaaact gggggatatt atgaagggcc ttgagcatct ggattctgcc taataaaaaa catttatttt
cattgc
− Трансляция в аминокислотную последовательность:
MVHLTPEEKSAVTALWGKVNVDEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFESF
GDLSTPDAVMGNPKVKAHGKKVLGAFSDGLAHLDNLKGTFATLSEL
HCDKLHVDPENFRLLGNVLVCVLAHHFGKEFTPPVQAAYQKVVAGV
ANALAHKYH
Используйте каждую из этих последовательностей для поиска при
помощи BLAST. Оцените результаты поиска. В чём смысл полей Score, E-
value и Identities (для ответа на вопрос нужно прокрутить страницу с
результатами вниз, до строк, начинающихся с >)?
− Каким организмам принадлежат эти последовательности?
− Какова функция белка, закодированного в этом гене?
− Какие последовательности довольно близки к исследуемому участку
ДНК? Каким организмам они принадлежат и какова их функция?
− Одинаковые ли результаты получились в трех поисковых запросах?
− Аккуратно удалите 21 нуклеотид из последовательностей мРНК и
сДНК и соответствующие аминокислоты из последовательности
белка. Изменило ли это результаты поиска BLAST?
− Аккуратно удалите некоторые нуклеотиды\аминокислоты в конце
последовательностей и попробуйте провести BLAST снова.
Получили ли Вы те же результаты? Каковы значения scores и
identities?
Сколько нуклеотидов\аминокислот нужно удалить для того,
чтобы поиск перестал выдавать прежние результаты?
Что произойдёт, если Вы удалите нуклеотиды\аминокислоты из
середины последовательностей?
Что произойдёт с трансляцией ДНК в аминокислотную
последовательность, если Вы удалите 1\2\3 нуклеотида из
середины последовательности?
Страницы
- « первая
- ‹ предыдущая
- …
- 12
- 13
- 14
- 15
- 16
- …
- следующая ›
- последняя »
