Биоинформатика. Порозов Ю.Б. - 36 стр.

UptoLike

ВУЗ: 

Университет ИТМО | Санкт-Петербург

Составители: 

Рубрика: 

34
последовательностей, соответствующие высоко консервативным
регионам (highly conserved regions) в белках. Отпечатки – это
резюме белковых «отпечатков пальцев» или fingerprints – группа
консервативных мотивов, используемая для описания,
аннотирования, характеризации семейств белков.
в) PHI-BLAST
(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/blast/Blast.cgi?PROGRAM=blastp&BLAST_
PROGRAMS=blastp&PAGE_TYPE=BlastSearch&SHOW_DEFAULTS=o
n&LINK_LOC=blasthome или http://mobyle.pasteur.fr/cgi-
bin/portal.py?#forms::phiblast ) – это BLAST, использующий паттерны
определенного формата (формат похож на Prosite, см. сайт PHI-BLAST)
для инициации поиска с использованием BLAST. Попробуйте провести
поиски с использованием PHI-BLAST.
Приложение к лабораторной работе № 5
Последовательности и материалы, необходимые для выполнения
лабораторной работы
Цитохромы Р450:
>1cpt00
>1bvyA0
>1eupA0
>1akd00
>1cmnA0
Globin Sequences (Beta-Chain)
Последовательности глобинов для лабораторной работы № 5 аналогичны
таковым для лабораторной работы № 4.
Лабораторная работа № 6
Филогенетические деревья
Цель лабораторной работы – получение практических навыков и
понимания филогенетических деревьев и их построения.
Программное обеспечение
Polytree: Вы можете использовать web-версию программы по адресу
http://www.dina.dk/~sestoft/bsa/Match7Applet.html
Phylip: Онлайн доступ к сервису Phylip:
http://bioweb2.pasteur.fr/phylogeny/intro-en.html. Список программ,
входящих в пакет Phylip, находится по адресу
http://evolution.genetics.washington.edu/phylip/programs.html. С сервера
Phylip можно скачать
(http://evolution.genetics.washington.edu/phylip/getme.html) и установить
этот пакет для использования на локальном компьютере. Там же находятся

Страницы