Современные методы исследований в биохимии. Битуева А.В. - 29 стр.

UptoLike

Составители: 

Рубрика: 

ПРЕИМУЩЕСТВА МЕТОДА
Полимеразная цепная реакция в настоящее время
является наиболее совершенным диагностическим методом,
позволяющим выявлять единичные клетки возбудителей
многих заболеваний за счет многократного увеличения
количества копий тестируемых специфических
последовательностей ДНК.
Тест-системы, основаны на принципе амплификации
ДНК, позволяет обнаруживать патогенные для человека
бактерии и вирусы даже в тех случаях, когда другими
способами (иммунологическим, бактериологическим,
микроскопическим) их выявление невозможно.
Это преимущество достигается за счет:
высокой чувствительности ПЦР - системы, которая
составляет около 10- 1000 бактериальных клеток, в то время
как чувствительность иммунологических и
микроскопических тестов колеблется в пределах 103-105
клеток;
высокой специфичности ПЦР, обусловленной тем, что
в исследуемом материале выявляется уникальный,
характерный только для данного возбудителя фрагмент ДНК.
Специфичность задается нуклеотидной последовательностью
праймеров, что исключает возможность получения ложных
результатов;
универсальности процедуры выявления различных
возбудителей;
высокой скорости получения результатов анализа. Для
проведения ПЦР-анализа не требуется выделение и
выращивание культуры возбудителя, что занимает большое
количество времени. Унифицированный метод обработки
биоматериала и детекции продуктов реакции, и
автоматизация процесса амплификации дают возможность
провести полный анализ за 4-4,5 часа.
Определение можно проводить непосредственно в
клиническом материале (кровь, сыворотка, мокрота, слюна,
желудочный сок, биопсийный материал, мазки, смывы) и в
материале, получаемом из объектов внешней среды (вода,
почва, пищевые продукты).
5.3. ПЦР в реальном времени.
На сегодня существует метод, превосходящий по своим
возможностям ПЦР - это метод ПЦР в реальном времени
(Real-Time PCR). Сущность метода заключается в
исследовании накопления продуктов амплификации с
помощью специального прибора без последующего
электрофореза. Так как кинетика накопления продуктов
амплификации связана с исходным количеством матрицы,
это дает возможность точно оценить её количество.
Отличительными чертами данного метода являются
- возможность количественного определения ДНК/РНК в
исследуемом материале,
- отсутствие стадии электрофореза,
- менее строгие требования к организации ПЦР-лаборатории
- автоматическая регистрация и интерпретация полученных
результатов.
Отсутствие стадии электрофореза позволяет минимизировать
риск контаминации продуктами ПЦР и таким образом резко
уменьшить число ложноположительных результатов.
Поскольку регистрация результатов проводится
непосредственно в процессе ПЦР, весь анализ можно
                   ПРЕИМУЩЕСТВА МЕТОДА                               Определение можно проводить непосредственно в
      Полимеразная цепная реакция в настоящее время           клиническом материале (кровь, сыворотка, мокрота, слюна,
является наиболее совершенным диагностическим методом,        желудочный сок, биопсийный материал, мазки, смывы) и в
позволяющим выявлять единичные клетки возбудителей            материале, получаемом из объектов внешней среды (вода,
многих заболеваний за счет многократного увеличения           почва, пищевые продукты).
количества      копий      тестируемых       специфических
последовательностей ДНК.
      Тест-системы, основаны на принципе амплификации                       5.3. ПЦР в реальном времени.
ДНК, позволяет обнаруживать патогенные для человека
бактерии и вирусы даже в тех случаях, когда другими                На сегодня существует метод, превосходящий по своим
способами      (иммунологическим,      бактериологическим,    возможностям ПЦР - это метод ПЦР в реальном времени
микроскопическим) их выявление невозможно.                    (Real-Time PCR). Сущность метода заключается в
      Это преимущество достигается за счет:                   исследовании накопления продуктов амплификации с
      высокой чувствительности ПЦР - системы, которая         помощью специального прибора без последующего
составляет около 10- 1000 бактериальных клеток, в то время    электрофореза. Так как кинетика накопления продуктов
как       чувствительность        иммунологических       и    амплификации связана с исходным количеством матрицы,
микроскопических тестов колеблется в пределах 103-105         это дает возможность точно оценить её количество.
клеток;
      высокой специфичности ПЦР, обусловленной тем, что       Отличительными чертами данного метода являются
в   исследуемом     материале     выявляется    уникальный,
характерный только для данного возбудителя фрагмент ДНК.      - возможность количественного определения ДНК/РНК в
Специфичность задается нуклеотидной последовательностью       исследуемом материале,
праймеров, что исключает возможность получения ложных
результатов;                                                  - отсутствие стадии электрофореза,
      универсальности процедуры выявления различных
возбудителей;                                                 - менее строгие требования к организации ПЦР-лаборатории
      высокой скорости получения результатов анализа. Для
                                                              - автоматическая регистрация и интерпретация полученных
проведения ПЦР-анализа не требуется выделение и               результатов.
выращивание культуры возбудителя, что занимает большое
количество времени. Унифицированный метод обработки           Отсутствие стадии электрофореза позволяет минимизировать
биоматериала     и   детекции     продуктов    реакции,  и    риск контаминации продуктами ПЦР и таким образом резко
автоматизация процесса амплификации дают возможность          уменьшить число ложноположительных результатов.
провести полный анализ за 4-4,5 часа.                         Поскольку      регистрация    результатов     проводится
                                                              непосредственно в процессе ПЦР, весь анализ можно