Современные методы исследований в биохимии. Битуева А.В - 32 стр.

     В пробе с отрицательным контролем должна
присутствовать одна слабо окрашенная и возможно не четкая
полоса, наиболее подвижная в направлении от старта
электрофореза. Размер ПЦР-продукта (неспецифический
фрагмент), формирующего эту полосу на электрофореграмме,
составляет около 50 п.н. Если в отрицательном контроле
присутствует бóльшее число полос, результаты проведенного
ПЦР-анализа следует считать недостоверными.                                                               160 п.н.
       Среди    продуктов     амплификации     ДНК     из                                                 ок. 50 п.н.
анализируемых образцов необходимо выделить лишь те,
размер которых в точности соответствует положительному и
отрицательному контролям. Вероятное присутствие всех
других полос полностью игнорируется. Образцы, в продуктах   Электрофореграмма продуктов амплификации
амплификации которых присутствует полоса 160 п.н. (как в    ДНК         генетически      модифицированных
положительном контроле), следует считать положительными.    (трансгенных) и нормальных растений, полученная с
В противном случае – отрицательными.                        использованием набора реагентов «35S-ПЦР ядро»
       В случаях, когда в ходе анализа получен              (ООО «Компания Биоком», Москва):
неоднозначный результат (слабая окраска, диффузное
размывание полос и пр.) необходимо повторное проведение     1 – отрицательный контроль (вода),
ПЦР с данным образцом, при этом для ПЦР используется 10     2-4 – ДНК из нормальных растений,
мкл полученного ранее экстракта ДНК. Если качественный      5-7 – ДНК из генетически модифицированных
результат не может быть достигнут таким способом,                 (трансгенных) растений,
требуется повторное проведение пробоподготовки из новой     8 – положительный контроль;
порции того же материала.
                                                                     -   специфический                  фрагмент,
                                                                         амплифицирующийся          только      с
                                                                         трансгенной ДНК (160 п.н.),
                                                                     -   неспецифический фрагмент (ок. 50 п.н.),
                                                                         свидетельствующий о нормальном ходе
                                                                         ПЦР при отсутствии специфического
                                                                         фрагмента (например, поз. 1 и 2).