Биоорганическая химия. Братцева И.А - 74 стр.

UptoLike

ВУЗ: 

СтГМУ | Ставрополь

Составители: 

Рубрика: 

147
Белки
Белки (протеины) – биополимеры, состоящие из α-аминокислот,
связанных пептидной связью и являющиеся носителями жизни.
CN
HO
( )
Условно считают, что пептиды содержат в молекуле до 100 (это соответст-
вует молекулярной массе до 10000) а белки свыше 100 аминокислотных
остатков (молекулярная масса от 10000 до нескольких миллионов).
Пептидная связь образуется за счет отщепления гидроксильной
группы от группы -СООН одной аминокислоты и водорода от α-
аминогруппы другой, с выделением молекулы воды.
CC
O
OH
H
R
NH
2
CC
O
OH
H
R
1
NH
H
NH
H
CC
O
OH
H
R
2
++
- 2H
2
O
N
H
CC
O
OH
H
R
2
CC
O
H
R
1
N
H
CC
O
H
R
NH
2
N-концевая
аминокислота
Трипептид
С-концевая
аминокислота
Пептидная свя зь
Название пептида начинается с N-концевой аминокислоты, с изменени-
ем окончания
ин на ил, в последней аминокислоте окончание не изменяется.
N-концевая аминокислота
- аланин
С-концевая аминокислота
- гистидин
Аланил
Лизил
Гистидин
Ала-Лиз-Гис
Или трехбуквенно:
N
NH
N
H
CC
O
OH
H
CH
2
CC
O
H
(CH
2
)
4
N
H
CC
O
H
СН
3
NH
2
NH
2
Данный пептид обладает основными свойствами, т.к. имеет избыток
аминогрупп.
Изоэлектрическая точка (ИЭТ) его лежит в щелочной среде.
Расшифровка первичной структуры белков
Первичная структура белка – это последовательное расположение
аминокислот в его молекуле. Характеризуется тремя параметрами: каче-
ственным, количественным наборами аминокислот и последовательно-
стью их соединения в полипептидной цепи.
148
Определение N – концевых аминокислот и аминокислотной последо-
вательности методом деградации
по Эдману с фенилизотиоцианатом (тио-
гидантоиновый метод). Принцип метода: реакция пептида с фенилизотио-
цианатом протекает как нуклеофильное присоединение (А
N
) по связи N=С и
приводит к образованию замещенной фенилтиомочевины. Образующийся
продукт претерпевает внутримолекулярную циклизацию с образованием со-
ответствующего γ-лактама (фенилтиогидантоина) с дальнейшим отщеплени-
ем его в результате гидролиза пептидной связи между первым и втором мо-
номерными звеньями. Идентифицируется он хроматографическим методом:
С
6
Н
5
N С S
+
NH
2
СН
R
CO NH СН СО NН СН СООН
R''R'
фенилизотиоцианат
трипептид
"меченый пептид"
NH СН
R
CO NH СН СО NН СН СООН
R''R'
С
S
NH
С
6
Н
5
1
3
5
2
4
1.
2. Циклизация (сближение атомов С
1
и С
5
) и гидролиз (Н
2
О, НСl)
NH
2
СН СО NН СН СООН
R''R'
+
ССН
NH
С
N
S
С
6
Н
5
O R
остаток
N-концевой
кислоты
тиогидантоин (
-лактам)
(идентификация проводится хроматографически)
"укороченный пептид"
После этого опять все начинается сначала по месту очередной амино-
кислоты c N-конца.
Определение N-концевой аминокислоты и первичной структуры
методом Сенгера –
исторически это был первый способ отщепления и иден-
тификации N-концевой аминокислоты (Ф. Сенгер, 1945 г.) Этим методом
была расшифрована первичная структура белка гормона инсулина. Пептид
обрабатывают в слабощелочной среде
2,4-динитрофторбензолом, а затем
полностью гидролизуют. Из гидролизата выделяют и идентифицируют
ДНФ-производное α-аминокислоты, находившейся на N-конце исходной
пептидной молекулы.

Страницы